27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0638 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0638  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  184  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.924785  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0811  hypothetical protein  47.25 
 
 		 93 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.695434  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2468  hypothetical protein  46.15 
 
 		 93 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0369  hypothetical protein  46.15 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881155  normal  0.619788 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2629  hypothetical protein  54.02 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.68562  normal  0.0365405 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3163  hypothetical protein  44.83 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.90075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2177  hypothetical protein  44.19 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1373  hypothetical protein  35.53 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398262  normal  0.0212038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3209  hypothetical protein  35.16 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0546803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4616  hypothetical protein  35.8 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1870  hypothetical protein  30 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.366753  normal  0.144606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2203  hypothetical protein  34.21 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.235035  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0907  hypothetical protein  36.51 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1782  hypothetical protein  35.29 
 
 		 79 aa  47.8  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4544  hypothetical protein  30.23 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0795163  normal  0.608799 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1370  protein of unknown function DUF1467  35.56 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3002  hypothetical protein  28.05 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1278  protein of unknown function DUF1467  33.72 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.231497  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2406  hypothetical protein  30.3 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724379  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0819  hypothetical protein  30.3 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0814  hypothetical protein  30.3 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1068  hypothetical protein  34.62 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.16521  normal  0.23729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1002  protein of unknown function DUF1467  34.62 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.252951  normal  0.212979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1197  protein of unknown function DUF1467  34.62 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1737  hypothetical protein  36.11 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4407  hypothetical protein  35.21 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.394794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2042  hypothetical protein  32.39 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645583  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>