31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0369 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0369  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881155  normal  0.619788 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2468  hypothetical protein  95.6 
 
 		 93 aa  174  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0811  hypothetical protein  95.6 
 
 		 93 aa  173  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.695434  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0638  hypothetical protein  46.15 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.924785  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2629  hypothetical protein  47.67 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.68562  normal  0.0365405 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3163  hypothetical protein  40.7 
 
 		 95 aa  67  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.90075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1373  hypothetical protein  41.33 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398262  normal  0.0212038 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2177  hypothetical protein  47.67 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4616  hypothetical protein  37.04 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2203  hypothetical protein  37.33 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.235035  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1782  hypothetical protein  38.03 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1870  hypothetical protein  29.63 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.366753  normal  0.144606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2042  hypothetical protein  46.55 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0907  hypothetical protein  34.04 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2283  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4544  hypothetical protein  28.74 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0795163  normal  0.608799 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3281  protein of unknown function DUF1467  36.99 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3209  hypothetical protein  31.76 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0546803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2421  hypothetical protein  36 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179452  normal  0.0325335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1002  protein of unknown function DUF1467  40.35 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.252951  normal  0.212979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1197  protein of unknown function DUF1467  40.35 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1068  hypothetical protein  40.35 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.16521  normal  0.23729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1052  protein of unknown function DUF1467  51.28 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141654 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3002  hypothetical protein  29.87 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1737  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476089  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0819  hypothetical protein  32.1 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0814  hypothetical protein  32.1 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2406  hypothetical protein  32.1 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724379  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2591  hypothetical protein  35.14 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4143  protein of unknown function DUF1467  38.89 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4407  hypothetical protein  38.89 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.394794 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>