30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2468 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2468  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0811  hypothetical protein  97.85 
 
 		 93 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.695434  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0369  hypothetical protein  95.6 
 
 		 93 aa  174  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881155  normal  0.619788 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0638  hypothetical protein  46.15 
 
 		 91 aa  88.2  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.924785  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2629  hypothetical protein  47.67 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.68562  normal  0.0365405 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3163  hypothetical protein  40.7 
 
 		 95 aa  67  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.90075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2177  hypothetical protein  46.51 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1373  hypothetical protein  36.26 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398262  normal  0.0212038 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4616  hypothetical protein  37.04 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2203  hypothetical protein  38.67 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.235035  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0907  hypothetical protein  36.17 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1870  hypothetical protein  30.86 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.366753  normal  0.144606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2042  hypothetical protein  46.55 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1782  hypothetical protein  36.99 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3209  hypothetical protein  34.12 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0546803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3281  protein of unknown function DUF1467  42.47 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2283  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  47.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4544  hypothetical protein  28.74 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0795163  normal  0.608799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2421  hypothetical protein  38.67 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179452  normal  0.0325335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1002  protein of unknown function DUF1467  40.35 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.252951  normal  0.212979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1068  hypothetical protein  40.35 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.16521  normal  0.23729 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1197  protein of unknown function DUF1467  40.35 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0814  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0819  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2406  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724379  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3002  hypothetical protein  31.03 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4407  hypothetical protein  40.85 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.394794 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1052  protein of unknown function DUF1467  51.28 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141654 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4143  protein of unknown function DUF1467  40.85 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666684  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1737  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>