33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3281 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3281  protein of unknown function DUF1467  100 
 
 		 93 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2868  hypothetical protein  72.34 
 
 		 94 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.205831  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2591  hypothetical protein  65.96 
 
 		 94 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2421  hypothetical protein  61.46 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179452  normal  0.0325335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4544  hypothetical protein  60.22 
 
 		 91 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0795163  normal  0.608799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1870  hypothetical protein  53.93 
 
 		 91 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.366753  normal  0.144606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2203  hypothetical protein  55.06 
 
 		 91 aa  94.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.235035  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4616  hypothetical protein  48.78 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2042  hypothetical protein  47.22 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4407  hypothetical protein  49.28 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.394794 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1782  hypothetical protein  48.53 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4143  protein of unknown function DUF1467  48.57 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666684  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3002  hypothetical protein  39.24 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3209  hypothetical protein  52.46 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0546803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1068  hypothetical protein  53.45 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.16521  normal  0.23729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1002  protein of unknown function DUF1467  53.45 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.252951  normal  0.212979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1197  protein of unknown function DUF1467  53.45 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0907  hypothetical protein  52.54 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219179  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0819  hypothetical protein  41.56 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0814  hypothetical protein  41.56 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2406  hypothetical protein  39.29 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724379  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1737  hypothetical protein  41.46 
 
 		 89 aa  52.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476089  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1373  hypothetical protein  36.36 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398262  normal  0.0212038 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1052  protein of unknown function DUF1467  58.33 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141654 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1370  protein of unknown function DUF1467  37.08 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2468  hypothetical protein  42.47 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1039  hypothetical protein  27.71 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000558059  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0811  hypothetical protein  39.73 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.695434  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0369  hypothetical protein  36.99 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881155  normal  0.619788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1278  protein of unknown function DUF1467  38.27 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.231497  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1292  hypothetical protein  35.06 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2283  hypothetical protein  30.38 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121116  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2629  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.68562  normal  0.0365405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>