33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1373 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1373  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  225  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398262  normal  0.0212038 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1870  hypothetical protein  45.33 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.366753  normal  0.144606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2203  hypothetical protein  46.77 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.235035  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0369  hypothetical protein  41.33 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881155  normal  0.619788 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1782  hypothetical protein  43.55 
 
 
79 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2406  hypothetical protein  31.94 
 
 
89 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724379  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0819  hypothetical protein  30.12 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0814  hypothetical protein  30.12 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2468  hypothetical protein  36.26 
 
 
93 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0811  hypothetical protein  36.26 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.695434  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4616  hypothetical protein  38.03 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2591  hypothetical protein  39.19 
 
 
94 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116849  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4544  hypothetical protein  36.84 
 
 
91 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0795163  normal  0.608799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2868  hypothetical protein  36.62 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.205831  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2421  hypothetical protein  32.89 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179452  normal  0.0325335 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3163  hypothetical protein  34.92 
 
 
95 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.90075  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1039  hypothetical protein  37.5 
 
 
89 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000558059  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1052  protein of unknown function DUF1467  46.81 
 
 
78 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141654 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0638  hypothetical protein  38.6 
 
 
91 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.924785  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1002  protein of unknown function DUF1467  33.33 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.252951  normal  0.212979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3281  protein of unknown function DUF1467  36.36 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1197  protein of unknown function DUF1467  33.33 
 
 
113 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1068  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.16521  normal  0.23729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2042  hypothetical protein  34.29 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645583  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4407  hypothetical protein  35.48 
 
 
111 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.394794 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1370  protein of unknown function DUF1467  35.48 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1278  protein of unknown function DUF1467  36.07 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.231497  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2629  hypothetical protein  31.94 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.68562  normal  0.0365405 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2177  hypothetical protein  38.57 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4143  protein of unknown function DUF1467  33.33 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3209  hypothetical protein  35.37 
 
 
92 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0546803  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0907  hypothetical protein  31.75 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219179  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1737  hypothetical protein  32.35 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>