30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1039 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1039  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  178  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000558059  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0819  hypothetical protein  47.73 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0814  hypothetical protein  47.73 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2406  hypothetical protein  45.45 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724379  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1737  hypothetical protein  39.33 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476089  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0907  hypothetical protein  45.45 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1370  protein of unknown function DUF1467  46.91 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1278  protein of unknown function DUF1467  44.44 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.231497  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2203  hypothetical protein  49.15 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.235035  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1870  hypothetical protein  45.76 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.366753  normal  0.144606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4616  hypothetical protein  34.18 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1373  hypothetical protein  37.5 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398262  normal  0.0212038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3002  hypothetical protein  38.46 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1782  hypothetical protein  40.32 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2421  hypothetical protein  35.62 
 
 		 95 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179452  normal  0.0325335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4544  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0795163  normal  0.608799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4143  protein of unknown function DUF1467  42.62 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4407  hypothetical protein  41.67 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.394794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2868  hypothetical protein  37.1 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.205831  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2283  hypothetical protein  35.71 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121116  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3281  protein of unknown function DUF1467  27.71 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3209  hypothetical protein  35.94 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0546803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1052  protein of unknown function DUF1467  41.86 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2591  hypothetical protein  35.29 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1068  hypothetical protein  36 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.16521  normal  0.23729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1002  protein of unknown function DUF1467  36 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.252951  normal  0.212979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1292  hypothetical protein  34.15 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1197  protein of unknown function DUF1467  36 
 
 		 113 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0130  hypothetical protein  36.23 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0081  hypothetical protein  36.23 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>