28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2591 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2591  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2868  hypothetical protein  70.21 
 
 		 94 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.205831  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3281  protein of unknown function DUF1467  65.96 
 
 		 93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2421  hypothetical protein  55.79 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179452  normal  0.0325335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4544  hypothetical protein  51.61 
 
 		 91 aa  97.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0795163  normal  0.608799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1870  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.366753  normal  0.144606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2203  hypothetical protein  47.83 
 
 		 91 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.235035  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4616  hypothetical protein  43.42 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4407  hypothetical protein  45.59 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.394794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2042  hypothetical protein  41.67 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1782  hypothetical protein  39.13 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4143  protein of unknown function DUF1467  44.12 
 
 		 111 aa  57  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666684  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1373  hypothetical protein  39.19 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398262  normal  0.0212038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3209  hypothetical protein  44.83 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0546803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3002  hypothetical protein  32.05 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1068  hypothetical protein  51.85 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.16521  normal  0.23729 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1197  protein of unknown function DUF1467  51.85 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1002  protein of unknown function DUF1467  51.85 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.252951  normal  0.212979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0907  hypothetical protein  40.32 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0814  hypothetical protein  36.36 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1052  protein of unknown function DUF1467  46.94 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141654 
 
 
-
 
NC_004310  BR0819  hypothetical protein  36.36 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1737  hypothetical protein  41.67 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476089  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0130  hypothetical protein  32.14 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1039  hypothetical protein  35.29 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000558059  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0081  hypothetical protein  31.33 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2406  hypothetical protein  31.82 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724379  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0369  hypothetical protein  35.14 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881155  normal  0.619788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>