31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3002 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3002  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  178  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2283  hypothetical protein  45.98 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121116  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1292  hypothetical protein  48.75 
 
 		 86 aa  68.2  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1870  hypothetical protein  39.77 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.366753  normal  0.144606 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1737  hypothetical protein  46.05 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476089  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0907  hypothetical protein  47.83 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3281  protein of unknown function DUF1467  39.24 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2421  hypothetical protein  36.59 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179452  normal  0.0325335 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2868  hypothetical protein  35.8 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.205831  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2406  hypothetical protein  40.45 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724379  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2629  hypothetical protein  34.94 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.68562  normal  0.0365405 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0814  hypothetical protein  41.18 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0819  hypothetical protein  41.18 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4616  hypothetical protein  42.86 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2203  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.235035  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4143  protein of unknown function DUF1467  48.28 
 
 		 111 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666684  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1782  hypothetical protein  39.06 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4407  hypothetical protein  48.28 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.394794 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1370  protein of unknown function DUF1467  45.16 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4544  hypothetical protein  33.77 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0795163  normal  0.608799 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1039  hypothetical protein  38.46 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000558059  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1278  protein of unknown function DUF1467  43.55 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.231497  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2591  hypothetical protein  32.05 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2042  hypothetical protein  34.38 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2468  hypothetical protein  31.03 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0811  hypothetical protein  31.03 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.695434  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0369  hypothetical protein  29.87 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881155  normal  0.619788 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0130  hypothetical protein  30.86 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1068  hypothetical protein  39.22 
 
 		 113 aa  40.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.16521  normal  0.23729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1002  protein of unknown function DUF1467  39.22 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.252951  normal  0.212979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1197  protein of unknown function DUF1467  39.22 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>