16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1292 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1292  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  173  7e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2283  hypothetical protein  43.02 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121116  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3002  hypothetical protein  48.75 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1870  hypothetical protein  37.97 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.366753  normal  0.144606 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0907  hypothetical protein  42.86 
 
 		 89 aa  48.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1737  hypothetical protein  44.62 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476089  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2406  hypothetical protein  32.93 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724379  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2868  hypothetical protein  35.8 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.205831  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2629  hypothetical protein  35 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.68562  normal  0.0365405 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3209  hypothetical protein  35.38 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0546803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2421  hypothetical protein  34.94 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179452  normal  0.0325335 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1039  hypothetical protein  34.15 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000558059  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3281  protein of unknown function DUF1467  35.06 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0819  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0814  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4407  hypothetical protein  36.11 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.394794 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>