28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2042 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2042  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  207  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1002  protein of unknown function DUF1467  58.88 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.252951  normal  0.212979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1068  hypothetical protein  61.36 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.16521  normal  0.23729 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1197  protein of unknown function DUF1467  61.36 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4143  protein of unknown function DUF1467  55.45 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4407  hypothetical protein  60 
 
 		 111 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.394794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3281  protein of unknown function DUF1467  47.22 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4616  hypothetical protein  45.78 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2591  hypothetical protein  41.67 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4544  hypothetical protein  43.06 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0795163  normal  0.608799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2421  hypothetical protein  38.16 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179452  normal  0.0325335 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2203  hypothetical protein  43.08 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.235035  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1782  hypothetical protein  44.59 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1870  hypothetical protein  37.1 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.366753  normal  0.144606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2868  hypothetical protein  41.67 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.205831  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2406  hypothetical protein  37.5 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724379  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1373  hypothetical protein  32.08 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398262  normal  0.0212038 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2468  hypothetical protein  46.55 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1052  protein of unknown function DUF1467  48.94 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141654 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0811  hypothetical protein  46.55 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.695434  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0369  hypothetical protein  46.55 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881155  normal  0.619788 
 
 
-
 
NC_004310  BR0819  hypothetical protein  32.89 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0814  hypothetical protein  32.89 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3002  hypothetical protein  34.38 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3209  hypothetical protein  45 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0546803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1737  hypothetical protein  43.55 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476089  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0907  hypothetical protein  36.07 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1278  protein of unknown function DUF1467  41.86 
 
 		 91 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.231497  normal  0.853408 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>