18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3163 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3163  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  189  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.90075  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2629  hypothetical protein  40 
 
 
95 aa  74.3  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.68562  normal  0.0365405 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0369  hypothetical protein  40.7 
 
 
93 aa  67  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881155  normal  0.619788 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2468  hypothetical protein  40.7 
 
 
93 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0638  hypothetical protein  44.83 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.924785  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0811  hypothetical protein  39.53 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.695434  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1870  hypothetical protein  35 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.366753  normal  0.144606 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2177  hypothetical protein  37.21 
 
 
86 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1373  hypothetical protein  34.92 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398262  normal  0.0212038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2203  hypothetical protein  39.06 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.235035  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1782  hypothetical protein  34.72 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4544  hypothetical protein  38.1 
 
 
91 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0795163  normal  0.608799 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2283  hypothetical protein  33.73 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121116  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3209  hypothetical protein  32.14 
 
 
92 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0546803  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2406  hypothetical protein  32.14 
 
 
89 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724379  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2868  hypothetical protein  34.85 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.205831  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2421  hypothetical protein  32.35 
 
 
95 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179452  normal  0.0325335 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1052  protein of unknown function DUF1467  45.65 
 
 
78 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>