100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0636 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0636  phospholipase/Carboxylesterase  100 
 
 
221 aa  430  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235231  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0355  phospholipase/Carboxylesterase  33.49 
 
 
207 aa  148  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0220103  normal  0.29368 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2687  phospholipase/carboxylesterase  36.45 
 
 
207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.398408  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0941  phospholipase/carboxylesterase  38.21 
 
 
552 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.443784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4181  phospholipase/carboxylesterase  29.82 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1685  phospholipase/Carboxylesterase  31.37 
 
 
212 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0645369  normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2499  phospholipase/Carboxylesterase  35.89 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.982674 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0274  phospholipase/Carboxylesterase  33.96 
 
 
222 aa  124  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1773  phospholipase/Carboxylesterase  37.02 
 
 
270 aa  124  9e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.200863  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5017  phospholipase/Carboxylesterase  30.23 
 
 
205 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122217  normal  0.0411034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5511  phospholipase/Carboxylesterase  31.58 
 
 
216 aa  115  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0336  phospholipase/Carboxylesterase  36.1 
 
 
216 aa  114  7.999999999999999e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0028  phospholipase/Carboxylesterase  33.76 
 
 
249 aa  108  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0609492 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4695  phospholipase/carboxylesterase  32.51 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0456  phospholipase/Carboxylesterase  31.16 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1449  phospholipase/Carboxylesterase  27.65 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.189744  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4590  phospholipase/Carboxylesterase  27.6 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1066  phospholipase/carboxylesterase  25.84 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.149249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1845  phospholipase/Carboxylesterase  32.84 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1688  putative phospholipase / carboxylesterase  31.87 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00377416  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4879  phospholipase/carboxylesterase  32.55 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2728  phospholipase/carboxylesterase  29.41 
 
 
220 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.56176  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2039  phospholipase/carboxylesterase  31.72 
 
 
223 aa  62  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1386  phospholipase/carboxylesterase  29.41 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167947  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  30.14 
 
 
248 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2077  phospholipase/carboxylesterase  28.63 
 
 
220 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3842  phospholipase/carboxylesterase  33.54 
 
 
236 aa  58.5  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0432  phospholipase/carboxylesterase  33.12 
 
 
233 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.332711 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3946  phospholipase/carboxylesterase  26.7 
 
 
219 aa  56.6  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2724  phospholipase/carboxylesterase  27.73 
 
 
237 aa  55.8  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124054  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1158  phospholipase/carboxylesterase  30 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0188854 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2351  phospholipase/carboxylesterase  30.32 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368946  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1965  phospholipase/carboxylesterase  29.61 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1633  esterase  27.14 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3813  phospholipase/carboxylesterase  29.14 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0993955  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2455  phospholipase/carboxylesterase  31.48 
 
 
221 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  28.7 
 
 
220 aa  51.6  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1976  phospholipase/Carboxylesterase  29.25 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.200865  normal  0.0252457 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03451  esterase  25.71 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1900  phospholipase/Carboxylesterase  28.15 
 
 
235 aa  50.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1261  carboxylesterase  29.17 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2337  carboxylesterase  31.71 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2265  carboxylesterase  31.71 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1326  phospholipase/carboxylesterase  28.64 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0935  phospholipase/carboxylesterase family protein  29.51 
 
 
213 aa  49.3  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2130  carboxylesterase  26.29 
 
 
222 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.939077  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0940  phospholipase/Carboxylesterase  30.77 
 
 
222 aa  49.3  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127105  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1632  phospholipase/carboxylesterase  27.45 
 
 
224 aa  48.9  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1494  phospholipase/carboxylesterase  27.45 
 
 
256 aa  48.5  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.259302  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2022  carboxylesterase  32.72 
 
 
226 aa  48.5  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000559029  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3639  Carboxylesterase  30.11 
 
 
223 aa  48.5  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02941  esterase  26.32 
 
 
201 aa  48.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.545653  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2114  phospholipase/Carboxylesterase  34.34 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0181  phospholipase/carboxylesterase  27.87 
 
 
213 aa  47  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1130  putative hydrolase ypfH  26.19 
 
 
219 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0811  phospholipase/Carboxylesterase  27.19 
 
 
220 aa  46.2  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.120747  normal  0.850191 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1071  carboxylesterase  27.71 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1950  carboxylesterase  30.37 
 
 
223 aa  45.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000802695  normal  0.0250693 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1610  phospholipase/carboxylesterase  27.98 
 
 
228 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.247692  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1958  phospholipase/carboxylesterase  27.98 
 
 
228 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0272  putative carboxylesterase  27.98 
 
 
228 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0149548  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1167  carboxylesterase, putative  27.98 
 
 
228 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00098882  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1942  phospholipase/carboxylesterase  27.98 
 
 
228 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3241  phospholipase/carboxylesterase  28.48 
 
 
222 aa  45.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774909  normal  0.296389 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1999  phospholipase/carboxylesterase family protein  29.52 
 
 
221 aa  45.4  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2107  carboxylesterase  27.98 
 
 
228 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.213325  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1189  phospholipase/Carboxylesterase  31.4 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  26.42 
 
 
220 aa  44.3  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2297  phospholipase/carboxylesterase  30.18 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563406  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0972  phospholipase/carboxylesterase  27.95 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0903  carboxylesterase  28.66 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.892603  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4553  carboxylesterase  29.3 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1674  carboxylesterase  29.57 
 
 
223 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843799  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4429  carboxylesterase  29.3 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.708757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2670  carboxylesterase  28.57 
 
 
223 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000549714  hitchhiker  0.00990238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3420  phospholipase/Carboxylesterase  27.33 
 
 
205 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1228  carboxylesterase  27.38 
 
 
224 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1327  phospholipase/carboxylesterase  25.74 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1296  carboxylesterase  29.3 
 
 
218 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1307  phospholipase/carboxylesterase  29.38 
 
 
220 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839904  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1899  Carboxylesterase  27.31 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2312  carboxylesterase  31.18 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295169  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2404  carboxylesterase, putative  27.06 
 
 
319 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0171467  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4278  putative carboxylesterase  28.22 
 
 
229 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4485  phospholipase/Carboxylesterase  27.03 
 
 
212 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0395  Carboxylesterase  27.51 
 
 
231 aa  43.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3092  phospholipase/carboxylesterase  33.49 
 
 
202 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0944125  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0063  phospholipase/carboxylesterase  30.11 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2701  carboxylesterase  32.5 
 
 
223 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83761  predicted protein  25.32 
 
 
233 aa  43.5  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.199859  normal  0.380866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0551  carboxylesterase protein  32.28 
 
 
226 aa  42.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315382  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1861  phospholipase/carboxylesterase  25.22 
 
 
228 aa  42.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2136  carboxylesterase  30.43 
 
 
224 aa  42  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000191828  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0345  carboxylesterase  26.35 
 
 
223 aa  42  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1246  carboxylesterase  32.23 
 
 
215 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3561  carboxylesterase  30.64 
 
 
219 aa  42  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.839773 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14080  carboxylesterase  32.23 
 
 
215 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  26.95 
 
 
204 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  26.95 
 
 
204 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4308  putative dienelactone hydrolase family protein, putative signal peptide  31.86 
 
 
308 aa  41.6  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0943242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>