More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1195 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1195  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  100 
 
 
258 aa  530  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0270  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.22 
 
 
249 aa  256  3e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.34 
 
 
209 aa  143  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2784  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.13 
 
 
211 aa  142  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0335572 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01520  uracil-DNA glycosylase, family 4  40 
 
 
195 aa  142  7e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0226409 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0798  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.68 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0091  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.44 
 
 
216 aa  137  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0119  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.41 
 
 
191 aa  136  4e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.76 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07710  uracil-DNA glycosylase, family 4  35.79 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1393  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.1 
 
 
210 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2071  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.98 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.99 
 
 
217 aa  129  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.863324  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2334  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.33 
 
 
219 aa  129  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.36 
 
 
186 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2893  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.73 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.260893  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.38 
 
 
210 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0290  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.94 
 
 
207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0795  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.57 
 
 
219 aa  125  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1244  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.95 
 
 
221 aa  125  8.000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0147  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.16 
 
 
202 aa  124  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1056  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.32 
 
 
196 aa  124  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.46 
 
 
193 aa  123  3e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.72 
 
 
199 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0483  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.41 
 
 
195 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000659964  normal  0.795166 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.91 
 
 
194 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.27 
 
 
192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1940  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.64 
 
 
205 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409376 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.62 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0839  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.98 
 
 
297 aa  119  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0413074 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  31.89 
 
 
210 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353711  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0365  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.11 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.52 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0717  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.56 
 
 
195 aa  116  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.667137 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.43 
 
 
205 aa  116  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0157  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.15 
 
 
200 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0205394  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.1 
 
 
300 aa  116  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3960  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.05 
 
 
191 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300932  hitchhiker  0.00000000403692 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1479  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.75 
 
 
184 aa  115  6e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1948  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.87 
 
 
190 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0411  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
193 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0426  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
193 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000629945  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2543  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.77 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0670794  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3015  uracil-DNA glycosylase  40.33 
 
 
218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2416  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.84 
 
 
190 aa  113  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3108  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.52 
 
 
189 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5828  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.39 
 
 
209 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2925  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.04 
 
 
259 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0265  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.26 
 
 
211 aa  113  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  36.56 
 
 
224 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3144  uracil-DNA glycosylase  40.33 
 
 
218 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0413  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.72 
 
 
242 aa  112  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.13684  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.83 
 
 
245 aa  111  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.57 
 
 
220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6057  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.86 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5015  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.88 
 
 
380 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.641312  normal  0.046521 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1364  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.61 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6465  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.61 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114604  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1364  putative DNA glycosylase  39.78 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.77623  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2882  uracil-DNA glycosylase family 4 protein  35.54 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1180  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.77 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.54 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.934489  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.29 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3067  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
187 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000874061  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0333  hypothetical protein  30.48 
 
 
200 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1723  putative phage DNA polymerase  36.53 
 
 
213 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.16 
 
 
205 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0936  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.69 
 
 
196 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4431  phage SPO1 DNA polymerase-like protein  32.2 
 
 
226 aa  109  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.696718  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.16 
 
 
295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_379  uracil DNA glycosylase superfamily, DNA polymerase bacteriophage-type  31.67 
 
 
206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1351  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.7 
 
 
226 aa  109  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5631  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.74 
 
 
217 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609757  normal  0.0369434 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.74 
 
 
217 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.500254 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1126  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.12 
 
 
235 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0314  hypothetical protein  30.48 
 
 
200 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0108  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.28 
 
 
187 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2161  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.5 
 
 
191 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.336529  hitchhiker  0.000279236 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0224  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.26 
 
 
259 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.215269  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0404  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.71 
 
 
214 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112864  normal  0.964796 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1838  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.51 
 
 
185 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.1 
 
 
341 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07331  Uracil-DNA glycosylase  37.28 
 
 
187 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.444861  hitchhiker  0.00512235 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1580  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  33.94 
 
 
220 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0245048  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.71 
 
 
330 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1397  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.81 
 
 
317 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.60425 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.8 
 
 
264 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4052  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.35 
 
 
202 aa  106  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.833859  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0893  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.64 
 
 
227 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148707 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1297  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.5 
 
 
187 aa  106  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2449  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.63 
 
 
210 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0503  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.77 
 
 
216 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.09 
 
 
243 aa  105  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1447  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.31 
 
 
200 aa  106  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1236  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.65 
 
 
220 aa  105  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.289271  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4359  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.45 
 
 
277 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0982104  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1870  Uracil-DNA glycosylase-like protein  32.18 
 
 
233 aa  105  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2607  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  36.43 
 
 
468 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5462  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.96 
 
 
219 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>