21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0873 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0873  hmc operon protein 5  100 
 
 
225 aa  447  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.727735  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2254  hmc operon protein 5  56.89 
 
 
225 aa  252  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2409  hmc operon protein 5  53.98 
 
 
226 aa  247  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2594  hmc operon protein 5  53.54 
 
 
226 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0649  hmc operon protein 5  55.71 
 
 
226 aa  244  9e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0572  hmc operon protein 5  49.77 
 
 
224 aa  221  8e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0846  hmc operon protein 5  46.9 
 
 
226 aa  206  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0125673  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0303  hypothetical protein  43.87 
 
 
225 aa  186  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1029  hypothetical protein  40 
 
 
219 aa  164  9e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2556  hypothetical protein  37.04 
 
 
219 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3708  hypothetical protein  38.43 
 
 
219 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0565  hypothetical protein  36.41 
 
 
219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533648  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2713  hypothetical protein  35.05 
 
 
219 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.992779  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0460  hypothetical protein  34.08 
 
 
222 aa  103  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165019  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1377  hypothetical protein  33.17 
 
 
219 aa  89  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1268  hypothetical protein  28.38 
 
 
219 aa  82  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2882  hypothetical protein  30.14 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3284  hypothetical protein  30.14 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1187  hypothetical protein  25.91 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.665213  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  27.8 
 
 
256 aa  42.7  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  28.7 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>