18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2409 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2409  hmc operon protein 5  100 
 
 		 226 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2594  hmc operon protein 5  85.4 
 
 		 226 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0649  hmc operon protein 5  75.22 
 
 		 226 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0846  hmc operon protein 5  56.19 
 
 		 226 aa  259  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0125673  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0873  hmc operon protein 5  53.98 
 
 		 225 aa  247  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.727735  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2254  hmc operon protein 5  53.54 
 
 		 225 aa  244  9e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0572  hmc operon protein 5  51.33 
 
 		 224 aa  228  7e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0303  hypothetical protein  41.23 
 
 		 225 aa  168  8e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1029  hypothetical protein  37.67 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2556  hypothetical protein  37.33 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2713  hypothetical protein  35.05 
 
 		 219 aa  125  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.992779  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3708  hypothetical protein  36.62 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0565  hypothetical protein  33.02 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0460  hypothetical protein  37.41 
 
 		 222 aa  101  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165019  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1377  hypothetical protein  31.78 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1268  hypothetical protein  30.26 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3284  hypothetical protein  29.95 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2882  hypothetical protein  29.95 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>