19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1029 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1029  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0303  hypothetical protein  54.59 
 
 		 225 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3708  hypothetical protein  49.77 
 
 		 219 aa  231  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0565  hypothetical protein  50.23 
 
 		 219 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533648  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2556  hypothetical protein  42.92 
 
 		 219 aa  191  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2713  hypothetical protein  40.18 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.992779  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2254  hmc operon protein 5  45.12 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0873  hmc operon protein 5  40 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.727735  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2409  hmc operon protein 5  37.67 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2594  hmc operon protein 5  37.33 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0649  hmc operon protein 5  37.56 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0846  hmc operon protein 5  32.09 
 
 		 226 aa  131  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0125673  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0572  hmc operon protein 5  32.26 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0460  hypothetical protein  41.43 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165019  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1377  hypothetical protein  30.1 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1268  hypothetical protein  29.55 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3284  hypothetical protein  27.14 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2882  hypothetical protein  27.14 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1187  hypothetical protein  28.44 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.665213  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>