18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2713 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2713  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  441  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.992779  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2556  hypothetical protein  68.04 
 
 
219 aa  315  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3708  hypothetical protein  58.9 
 
 
219 aa  275  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0303  hypothetical protein  47.25 
 
 
225 aa  209  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1029  hypothetical protein  40.18 
 
 
219 aa  190  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0565  hypothetical protein  43.38 
 
 
219 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2254  hmc operon protein 5  37.38 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2594  hmc operon protein 5  35.51 
 
 
226 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2409  hmc operon protein 5  35.05 
 
 
226 aa  125  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0873  hmc operon protein 5  35.05 
 
 
225 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.727735  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0572  hmc operon protein 5  40.93 
 
 
224 aa  122  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0649  hmc operon protein 5  34.74 
 
 
226 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0846  hmc operon protein 5  34.85 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0125673  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0460  hypothetical protein  36.67 
 
 
222 aa  98.6  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165019  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1377  hypothetical protein  29.9 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1268  hypothetical protein  24.39 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3284  hypothetical protein  25.59 
 
 
221 aa  48.5  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2882  hypothetical protein  25.59 
 
 
221 aa  48.5  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>