24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1268 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1268  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2882  hypothetical protein  55.05 
 
 
221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3284  hypothetical protein  55.05 
 
 
221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1187  hypothetical protein  42.79 
 
 
225 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.665213  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1377  hypothetical protein  39.81 
 
 
219 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0846  hmc operon protein 5  30.3 
 
 
226 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0125673  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0873  hmc operon protein 5  28.38 
 
 
225 aa  82  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.727735  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1029  hypothetical protein  29.55 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2254  hmc operon protein 5  31.82 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2409  hmc operon protein 5  30.26 
 
 
226 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0303  hypothetical protein  27.01 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2594  hmc operon protein 5  26.67 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0649  hmc operon protein 5  29.46 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0572  hmc operon protein 5  24.39 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0565  hypothetical protein  22.9 
 
 
219 aa  62  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533648  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2556  hypothetical protein  25.91 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3708  hypothetical protein  26.32 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2713  hypothetical protein  24.39 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.992779  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2896  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  34.07 
 
 
384 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.217971 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  32.22 
 
 
277 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1113  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  31.82 
 
 
384 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0397617  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1963  quinone-interacting membrane-bound oxidoreductase complex subunit C  35.23 
 
 
407 aa  43.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829701 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0177  nitrate reductase, gamma subunit  28.28 
 
 
302 aa  42.4  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.862434 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0338  nitrate reductase gamma subunit  28.28 
 
 
302 aa  42  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0229236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>