20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0572 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0572  hmc operon protein 5  100 
 
 
224 aa  447  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2594  hmc operon protein 5  50.88 
 
 
226 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2409  hmc operon protein 5  51.33 
 
 
226 aa  230  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0873  hmc operon protein 5  49.77 
 
 
225 aa  228  5e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.727735  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2254  hmc operon protein 5  50.67 
 
 
225 aa  225  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0649  hmc operon protein 5  50.44 
 
 
226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0846  hmc operon protein 5  46.9 
 
 
226 aa  208  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0125673  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0303  hypothetical protein  35.27 
 
 
225 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1029  hypothetical protein  32.26 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2713  hypothetical protein  40.93 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.992779  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0565  hypothetical protein  33.79 
 
 
219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533648  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2556  hypothetical protein  34.67 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3708  hypothetical protein  34.53 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0460  hypothetical protein  26.74 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165019  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1268  hypothetical protein  24.39 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2882  hypothetical protein  27.83 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3284  hypothetical protein  27.83 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1377  hypothetical protein  27.36 
 
 
219 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1187  hypothetical protein  26.94 
 
 
225 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.665213  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.97 
 
 
233 aa  42  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0298613  normal  0.327714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>