19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3708 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3708  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  441  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2556  hypothetical protein  62.1 
 
 
219 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2713  hypothetical protein  58.9 
 
 
219 aa  275  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.992779  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1029  hypothetical protein  49.77 
 
 
219 aa  231  9e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0303  hypothetical protein  52.56 
 
 
225 aa  228  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0565  hypothetical protein  49.77 
 
 
219 aa  211  4.9999999999999996e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2254  hmc operon protein 5  39.25 
 
 
225 aa  145  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0873  hmc operon protein 5  38.43 
 
 
225 aa  137  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.727735  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2409  hmc operon protein 5  36.62 
 
 
226 aa  124  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2594  hmc operon protein 5  34.6 
 
 
226 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0846  hmc operon protein 5  37.09 
 
 
226 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0125673  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0649  hmc operon protein 5  35.29 
 
 
226 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0572  hmc operon protein 5  34.53 
 
 
224 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0460  hypothetical protein  32.73 
 
 
222 aa  102  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165019  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1377  hypothetical protein  26.24 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1268  hypothetical protein  26.32 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3284  hypothetical protein  26.76 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2882  hypothetical protein  26.76 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1187  hypothetical protein  24.88 
 
 
225 aa  45.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.665213  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>