19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2254 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2254  hmc operon protein 5  100 
 
 		 225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0873  hmc operon protein 5  56.89 
 
 		 225 aa  265  5e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.727735  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2409  hmc operon protein 5  53.54 
 
 		 226 aa  254  8e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2594  hmc operon protein 5  50.88 
 
 		 226 aa  245  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0649  hmc operon protein 5  53.1 
 
 		 226 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0572  hmc operon protein 5  50.67 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0846  hmc operon protein 5  48.67 
 
 		 226 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0125673  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1029  hypothetical protein  45.12 
 
 		 219 aa  189  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0303  hypothetical protein  47 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0565  hypothetical protein  42.79 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533648  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3708  hypothetical protein  39.25 
 
 		 219 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2713  hypothetical protein  37.38 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.992779  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2556  hypothetical protein  36.57 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0460  hypothetical protein  38.78 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165019  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1268  hypothetical protein  30.77 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2882  hypothetical protein  30.28 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3284  hypothetical protein  30.28 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1377  hypothetical protein  28.37 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1187  hypothetical protein  27.35 
 
 		 225 aa  52  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.665213  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>