21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3284 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_3284  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2882  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1268  hypothetical protein  55.05 
 
 		 219 aa  232  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1377  hypothetical protein  42.13 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1187  hypothetical protein  42.08 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.665213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0846  hmc operon protein 5  34.06 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0125673  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0303  hypothetical protein  28.57 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0873  hmc operon protein 5  30.14 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.727735  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1029  hypothetical protein  27.14 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2409  hmc operon protein 5  29.95 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2594  hmc operon protein 5  29.36 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0649  hmc operon protein 5  28.9 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2254  hmc operon protein 5  30.28 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0572  hmc operon protein 5  27.83 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0565  hypothetical protein  26.54 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533648  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2556  hypothetical protein  28.51 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3708  hypothetical protein  26.76 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0460  hypothetical protein  31.16 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165019  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2713  hypothetical protein  25.35 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.992779  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  23.97 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  23.75 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>