19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0846 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0846  hmc operon protein 5  100 
 
 
226 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0125673  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2409  hmc operon protein 5  56.19 
 
 
226 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2594  hmc operon protein 5  50.88 
 
 
226 aa  242  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0649  hmc operon protein 5  53.98 
 
 
226 aa  241  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2254  hmc operon protein 5  48.67 
 
 
225 aa  211  7e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0873  hmc operon protein 5  46.9 
 
 
225 aa  206  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.727735  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0572  hmc operon protein 5  46.9 
 
 
224 aa  204  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0303  hypothetical protein  32.09 
 
 
225 aa  132  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1029  hypothetical protein  32.09 
 
 
219 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3708  hypothetical protein  37.09 
 
 
219 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2713  hypothetical protein  34.85 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.992779  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2556  hypothetical protein  33.49 
 
 
219 aa  101  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0565  hypothetical protein  30.7 
 
 
219 aa  96.7  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533648  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1377  hypothetical protein  34.26 
 
 
219 aa  90.9  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1268  hypothetical protein  30.3 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2882  hypothetical protein  34.06 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3284  hypothetical protein  34.06 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0460  hypothetical protein  32 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165019  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1187  hypothetical protein  25.11 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.665213  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>