19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0565 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0565  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533648  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1029  hypothetical protein  50.23 
 
 
219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3708  hypothetical protein  49.77 
 
 
219 aa  228  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0303  hypothetical protein  50.93 
 
 
225 aa  224  6e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2556  hypothetical protein  45.21 
 
 
219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2713  hypothetical protein  43.38 
 
 
219 aa  188  5e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.992779  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2254  hmc operon protein 5  42.79 
 
 
225 aa  165  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0873  hmc operon protein 5  36.41 
 
 
225 aa  138  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.727735  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0572  hmc operon protein 5  33.79 
 
 
224 aa  124  9e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2409  hmc operon protein 5  33.02 
 
 
226 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0460  hypothetical protein  32.59 
 
 
222 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165019  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2594  hmc operon protein 5  31.63 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0649  hmc operon protein 5  33.18 
 
 
226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0846  hmc operon protein 5  30.7 
 
 
226 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0125673  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3284  hypothetical protein  26.54 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2882  hypothetical protein  26.54 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1268  hypothetical protein  23.94 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1377  hypothetical protein  23.7 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10343  iron-sulfur-binding reductase  32.22 
 
 
882 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.557854  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>