47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3251 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3251  hexapeptide repeat-containing oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family transferase  100 
 
 
79 aa  161  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1139  oxidoreductase domain protein  58.97 
 
 
317 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0307  oxidoreductase domain protein  38.36 
 
 
351 aa  59.3  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  39.74 
 
 
517 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  39.74 
 
 
517 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0576  oxidoreductase domain protein  37.68 
 
 
315 aa  57.8  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  34.62 
 
 
344 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  36.23 
 
 
335 aa  53.9  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
345 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
334 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  35.71 
 
 
330 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  41.38 
 
 
310 aa  50.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  39.34 
 
 
311 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  41.94 
 
 
331 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  40.74 
 
 
316 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3200  oxidoreductase domain-containing protein  36.49 
 
 
353 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  37.93 
 
 
310 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0798  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  35.14 
 
 
375 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.74 
 
 
319 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.77 
 
 
318 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
322 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  35 
 
 
318 aa  43.9  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1079  oxidoreductase  32.91 
 
 
340 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00272705  normal  0.0148491 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  36.76 
 
 
317 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  33.77 
 
 
387 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  34.25 
 
 
326 aa  43.5  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.03 
 
 
317 aa  43.5  0.0009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  32.88 
 
 
328 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1558  oxidoreductase domain protein  32.43 
 
 
343 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0106929  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1531  oxidoreductase domain protein  32.43 
 
 
343 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  34.38 
 
 
313 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
405 aa  41.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2766  oxidoreductase domain-containing protein  37.04 
 
 
320 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.49 
 
 
332 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1457  oxidoreductase, NAD-binding  43.59 
 
 
313 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1173  oxidoreductase domain protein  43.59 
 
 
313 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0559486  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  32.76 
 
 
314 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  36.36 
 
 
364 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  32.91 
 
 
333 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  34.85 
 
 
374 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 
329 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3750  hypothetical protein  43.75 
 
 
649 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162114  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 
331 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1482  oxidoreductase domain protein  40.74 
 
 
337 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  33.78 
 
 
341 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.55 
 
 
317 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 
344 aa  40  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>