More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4620 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4620  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
258 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0169  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  53.26 
 
 
262 aa  287  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.875219  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0462  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.53 
 
 
261 aa  284  9e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.39 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1199  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.44 
 
 
263 aa  238  8e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0291  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50 
 
 
253 aa  236  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.105514  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1579  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.49 
 
 
262 aa  226  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1800  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.03 
 
 
295 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.51699  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2007  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  43.19 
 
 
298 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.52 
 
 
300 aa  218  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.393314  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1871  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.52 
 
 
300 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0876  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.65 
 
 
352 aa  216  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2251  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.57 
 
 
353 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000010611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1060  formate dehydrogenase beta subunit  43.27 
 
 
277 aa  208  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0770769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2266  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.62 
 
 
279 aa  205  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0778  formate dehydrogenase, iron-sulfur subunit  39.76 
 
 
277 aa  205  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2406  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.18 
 
 
370 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0152332 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3387  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.39 
 
 
281 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.55 
 
 
278 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.19 
 
 
352 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1043  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41 
 
 
280 aa  198  7e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.41 
 
 
244 aa  196  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0528113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0678  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.52 
 
 
302 aa  192  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000723832 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.82 
 
 
372 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0652  hypothetical protein  39.68 
 
 
367 aa  188  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0665  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.49 
 
 
302 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2087  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  39.02 
 
 
731 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3653  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.67 
 
 
307 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00120014  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2601  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.3 
 
 
261 aa  184  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.68 
 
 
731 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1869  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.68 
 
 
731 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.856186  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0256  formate dehydrogenase beta subunit  39.62 
 
 
267 aa  182  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_122  Ni/Fe hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit  39.62 
 
 
267 aa  182  6e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0112  [Ni/Fe] hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit, putative  39.62 
 
 
267 aa  181  7e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.240975  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2944  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.8 
 
 
255 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.308792  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3042  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.11 
 
 
744 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1705  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.68 
 
 
302 aa  178  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.295488  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.13 
 
 
729 aa  175  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2039  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.9 
 
 
367 aa  169  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0783  hydrogenase 2 protein HybA  36.94 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.311575  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3522  hydrogenase 2 protein HybA  35.02 
 
 
293 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.43405 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0145  hydrogenase 2 protein HybA  36.05 
 
 
313 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1124  hydrogenase 2 protein HybA  34.11 
 
 
309 aa  156  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1944  hydrogenase 2 protein HybA  34.98 
 
 
311 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.422273  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3138  hydrogenase 2 protein HybA  33.33 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0480  hydrogenase 2 protein HybA  33.21 
 
 
317 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4238  hydrogenase 2 protein HybA  38.5 
 
 
308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0508  hydrogenase 2 protein HybA  33.21 
 
 
317 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0513  hydrogenase 2 protein HybA  33.21 
 
 
317 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0525  hydrogenase 2 protein HybA  33.93 
 
 
316 aa  148  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0490  formate dehydrogenase, beta subunit  36.36 
 
 
316 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.373896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0533  formate dehydrogenase, beta subunit  36.36 
 
 
316 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0524  formate dehydrogenase, beta subunit  36.36 
 
 
316 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63580  nitrate-inducible formate dehydrogenase, beta subunit  34.92 
 
 
309 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.936604  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1411  hydrogenase 2 protein HybA  32.64 
 
 
338 aa  142  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2699  formate dehydrogenase beta subunit  35.71 
 
 
311 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0545  formate dehydrogenase, beta subunit  35.71 
 
 
318 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.130453 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4270  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.42 
 
 
271 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5530  nitrate-inducible formate dehydrogenase subunit beta  34.52 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02872  hydrogenase 2 4Fe-4S ferredoxin-type component  30.71 
 
 
328 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.71 
 
 
328 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0697  hydrogenase 2 protein HybA  30.71 
 
 
328 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02821  hypothetical protein  30.71 
 
 
328 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3465  hydrogenase 2 protein HybA  30.71 
 
 
328 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3423  hydrogenase 2 protein HybA  30.71 
 
 
328 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4308  hydrogenase 2 protein HybA  30.71 
 
 
328 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3282  hydrogenase 2 protein HybA  30.71 
 
 
328 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2533  hydrogenase 2 protein HybA  31.83 
 
 
338 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.412002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3176  hydrogenase 2 protein HybA  30.71 
 
 
328 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3331  hydrogenase 2 protein HybA  31.95 
 
 
328 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.791401  normal  0.586002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3322  hydrogenase 2 protein HybA  31.95 
 
 
328 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.521009  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3402  hydrogenase 2 protein HybA  31.95 
 
 
328 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.38482  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3396  hydrogenase 2 protein HybA  31.95 
 
 
328 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3497  hydrogenase 2 protein HybA  31.95 
 
 
328 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.21582  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1824  formate dehydrogenase beta subunit  32.17 
 
 
270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0798  formate dehydrogenase iron-sulfur subunit  38.14 
 
 
266 aa  132  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4089  hydrogenase 2 protein HybA  31.29 
 
 
331 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.224971  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1817  formate dehydrogenase beta subunit  33.33 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.814404  normal  0.117149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1574  Formate dehydrogenase transmembrane domain protein  37.04 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3378  formate dehydrogenase, beta subunit  32.94 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749557  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2505  hydrogenase 2 protein HybA  32.39 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.13164 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3880  formate dehydrogenase, beta subunit  32.94 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.670171  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3373  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2639  Formate dehydrogenase transmembrane domain protein  37.04 
 
 
263 aa  129  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.276206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2099  formate dehydrogenase beta subunit  32.54 
 
 
304 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.860048 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4381  formate dehydrogenase, beta subunit  32.54 
 
 
304 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.762924  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3985  formate dehydrogenase, beta subunit  32.54 
 
 
304 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3543  formate dehydrogenase, beta subunit  32.54 
 
 
304 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0467052  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03820  formate dehydrogenase, beta subunit  33.46 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217322  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4596  formate dehydrogenase, beta subunit  32.54 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247951  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3973  hydrogenase 2 protein HybA  30.43 
 
 
351 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.253471  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0085  formate dehydrogenase, beta subunit  31.87 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1682  formate dehydrogenase, beta subunit  31.35 
 
 
304 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.777312  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1693  formate dehydrogenase, beta subunit  31.35 
 
 
304 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1900  formate dehydrogenase, beta subunit  31.35 
 
 
304 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152074  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2258  formate dehydrogenase, beta subunit  31.35 
 
 
304 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.103418  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0572  formate dehydrogenase, beta subunit  31.35 
 
 
304 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0383957  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0729  formate dehydrogenase, beta subunit  31.35 
 
 
304 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2395  formate dehydrogenase, beta subunit  31.35 
 
 
304 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496326  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2053  formate dehydrogenase beta subunit  31.87 
 
 
294 aa  125  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>