More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4270 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4270  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
271 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1824  formate dehydrogenase beta subunit  56.3 
 
 
270 aa  338  5e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0105  formate dehydrogenase, beta subunit  44.32 
 
 
303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0101  formate dehydrogenase, beta subunit  44.32 
 
 
303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0102  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  43.56 
 
 
304 aa  219  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0439  formate dehydrogenase, beta subunit  43.33 
 
 
300 aa  219  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0106  formate dehydrogenase, beta subunit  43.94 
 
 
303 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0533  formate dehydrogenase, beta subunit  46.79 
 
 
316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0098  formate dehydrogenase beta subunit  43.18 
 
 
304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0103  formate dehydrogenase beta subunit  43.18 
 
 
304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0490  formate dehydrogenase, beta subunit  46.21 
 
 
316 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.373896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0524  formate dehydrogenase, beta subunit  46.21 
 
 
316 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0103  formate dehydrogenase beta subunit  43.18 
 
 
304 aa  215  7e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0545  formate dehydrogenase, beta subunit  45.45 
 
 
318 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.130453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2699  formate dehydrogenase beta subunit  45.08 
 
 
311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0798  formate dehydrogenase iron-sulfur subunit  42.59 
 
 
266 aa  212  5.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5530  nitrate-inducible formate dehydrogenase subunit beta  44.32 
 
 
309 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63580  nitrate-inducible formate dehydrogenase, beta subunit  44.91 
 
 
309 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.936604  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1817  formate dehydrogenase beta subunit  44.4 
 
 
295 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.814404  normal  0.117149 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3262  formate dehydrogenase, beta subunit  44.66 
 
 
305 aa  205  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2090  formate dehydrogenase beta subunit  41.67 
 
 
300 aa  204  9e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134298 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1209  formate dehydrogenase, iron-sulfur subunit  45.81 
 
 
290 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.796434  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1428  formate dehydrogenase, beta subunit  42.48 
 
 
300 aa  203  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0708  formate dehydrogenase, beta subunit  46.12 
 
 
304 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2592  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.62 
 
 
275 aa  203  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0085  formate dehydrogenase, beta subunit  42.21 
 
 
299 aa  202  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2099  formate dehydrogenase beta subunit  44.66 
 
 
304 aa  202  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.860048 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4596  formate dehydrogenase, beta subunit  44.66 
 
 
304 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247951  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4381  formate dehydrogenase, beta subunit  45.31 
 
 
304 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.762924  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3985  formate dehydrogenase, beta subunit  45.31 
 
 
304 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3543  formate dehydrogenase, beta subunit  45.31 
 
 
304 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0467052  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1682  formate dehydrogenase, beta subunit  45.71 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.777312  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0729  formate dehydrogenase, beta subunit  45.71 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1693  formate dehydrogenase, beta subunit  45.71 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1900  formate dehydrogenase, beta subunit  45.71 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152074  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2395  formate dehydrogenase, beta subunit  45.71 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496326  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2258  formate dehydrogenase, beta subunit  45.71 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.103418  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0572  formate dehydrogenase, beta subunit  45.71 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0383957  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1738  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  41.29 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3373  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.6 
 
 
258 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6559  formate dehydrogenase, beta subunit  43.67 
 
 
310 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00146012  hitchhiker  0.00275448 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3880  formate dehydrogenase, beta subunit  43.87 
 
 
304 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.670171  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3378  formate dehydrogenase, beta subunit  43.87 
 
 
304 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749557  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4519  formate dehydrogenase, beta subunit  43.57 
 
 
312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2172  formate dehydrogenase, beta subunit  40.91 
 
 
294 aa  199  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.402414  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2182  formate dehydrogenase, beta subunit  40.91 
 
 
294 aa  199  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1657  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  40.91 
 
 
294 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1558  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  40.91 
 
 
294 aa  199  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4086  formate dehydrogenase beta subunit  40.98 
 
 
307 aa  199  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.681709  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01433  formate dehydrogenase-N, Fe-S (beta) subunit, nitrate-inducible  40.91 
 
 
294 aa  198  7e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01445  hypothetical protein  40.91 
 
 
294 aa  198  7e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1699  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  43.04 
 
 
294 aa  198  9e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.808171  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03778  formate dehydrogenase-O, Fe-S subunit  39.7 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4125  formate dehydrogenase, beta subunit  39.7 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4091  formate dehydrogenase, beta subunit  39.7 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5343  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  39.7 
 
 
300 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.82838 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4121  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  39.7 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03727  hypothetical protein  39.7 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4372  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  39.7 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4422  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  39.7 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4279  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  39.7 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2087  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  40.53 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1091  formate dehydrogenase, beta subunit  45.04 
 
 
311 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.917887 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1285  formate dehydrogenase, beta subunit  39.1 
 
 
302 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.519399  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2552  formate dehydrogenase beta subunit  43.27 
 
 
310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0661  formate dehydrogenase, beta subunit  44.35 
 
 
323 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2518  formate dehydrogenase, beta subunit  41.84 
 
 
300 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.583749  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1334  formate dehydrogenase, beta subunit  38.52 
 
 
302 aa  195  8.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3326  formate dehydrogenase, beta subunit  44.98 
 
 
302 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.760474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3489  formate dehydrogenase, beta subunit  45.45 
 
 
309 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0543502  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3769  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  42.39 
 
 
323 aa  193  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1774  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  39.39 
 
 
294 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0796568  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0039  formate dehydrogenase, beta subunit  42.39 
 
 
323 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1596  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  39.39 
 
 
294 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1683  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  39.39 
 
 
292 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4118  putative aerobic formate dehydrogenase, iron-sulfur subunit  42.39 
 
 
323 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1685  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  39.39 
 
 
294 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1751  formate dehydrogenase beta subunit  42.61 
 
 
295 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.587203  hitchhiker  0.00082122 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1746  formate dehydrogenase iron-sulfur subunit  39.39 
 
 
294 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.644795  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03820  formate dehydrogenase, beta subunit  42.48 
 
 
297 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217322  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2053  formate dehydrogenase beta subunit  39.77 
 
 
294 aa  192  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0869  formate dehydrogenase beta subunit  43.59 
 
 
296 aa  192  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1574  Formate dehydrogenase transmembrane domain protein  40.5 
 
 
262 aa  191  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3046  formate dehydrogenase, beta subunit  40.95 
 
 
302 aa  191  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2639  Formate dehydrogenase transmembrane domain protein  38.66 
 
 
263 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.276206 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4362  formate dehydrogenase-O iron-sulfur subunit  42.11 
 
 
300 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4271  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  42.11 
 
 
300 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4249  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  42.11 
 
 
300 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.896409  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4316  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  42.11 
 
 
300 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2661  formate dehydrogenase, beta subunit  40.95 
 
 
302 aa  189  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.577915  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4427  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  41.67 
 
 
300 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1681  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.96 
 
 
307 aa  187  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.175927  normal  0.368411 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3811  formate dehydrogenase, beta subunit  41.33 
 
 
291 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3755  formate dehydrogenase beta subunit  40.38 
 
 
291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3895  formate dehydrogenase, beta subunit  40.96 
 
 
291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2864  formate dehydrogenase, beta subunit  41.23 
 
 
313 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00319725  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0611  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.69 
 
 
279 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2828  formate dehydrogenase, beta subunit  42.36 
 
 
332 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.73714  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0112  [Ni/Fe] hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit, putative  41.83 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.240975  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2009  formate dehydrogenase, beta subunit  40.17 
 
 
290 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.340438  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>