More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2505 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2505  hydrogenase 2 protein HybA  100 
 
 
340 aa  709    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.13164 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02872  hydrogenase 2 4Fe-4S ferredoxin-type component  50.46 
 
 
328 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50.46 
 
 
328 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02821  hypothetical protein  50.46 
 
 
328 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3282  hydrogenase 2 protein HybA  50.46 
 
 
328 aa  350  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4308  hydrogenase 2 protein HybA  50.46 
 
 
328 aa  350  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3423  hydrogenase 2 protein HybA  50.46 
 
 
328 aa  350  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0697  hydrogenase 2 protein HybA  50.46 
 
 
328 aa  350  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3465  hydrogenase 2 protein HybA  50.46 
 
 
328 aa  350  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4089  hydrogenase 2 protein HybA  50.91 
 
 
331 aa  348  7e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.224971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3176  hydrogenase 2 protein HybA  50.15 
 
 
328 aa  348  8e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1411  hydrogenase 2 protein HybA  50.91 
 
 
338 aa  346  3e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3396  hydrogenase 2 protein HybA  50.3 
 
 
328 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3331  hydrogenase 2 protein HybA  50.3 
 
 
328 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.791401  normal  0.586002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3322  hydrogenase 2 protein HybA  50.3 
 
 
328 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.521009  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3402  hydrogenase 2 protein HybA  50.3 
 
 
328 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.38482  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3497  hydrogenase 2 protein HybA  50.3 
 
 
328 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.21582  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2533  hydrogenase 2 protein HybA  49.56 
 
 
338 aa  339  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.412002  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3973  hydrogenase 2 protein HybA  45.38 
 
 
351 aa  311  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.253471  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1124  hydrogenase 2 protein HybA  38.99 
 
 
309 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0783  hydrogenase 2 protein HybA  43.39 
 
 
305 aa  242  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.311575  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3138  hydrogenase 2 protein HybA  38.69 
 
 
309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1944  hydrogenase 2 protein HybA  38.63 
 
 
311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.422273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0145  hydrogenase 2 protein HybA  38.17 
 
 
313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4238  hydrogenase 2 protein HybA  38.58 
 
 
308 aa  221  9e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0525  hydrogenase 2 protein HybA  39.61 
 
 
316 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0480  hydrogenase 2 protein HybA  39.47 
 
 
317 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0508  hydrogenase 2 protein HybA  39.82 
 
 
317 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0513  hydrogenase 2 protein HybA  39.82 
 
 
317 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3522  hydrogenase 2 protein HybA  36.27 
 
 
293 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.43405 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.13 
 
 
352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.03 
 
 
372 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1800  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.43 
 
 
295 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.51699  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0652  hypothetical protein  32.13 
 
 
367 aa  166  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2251  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.53 
 
 
353 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000010611  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0112  [Ni/Fe] hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit, putative  32.09 
 
 
267 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.240975  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0876  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.79 
 
 
352 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
269 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3042  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.64 
 
 
744 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2944  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.1 
 
 
255 aa  162  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.308792  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_122  Ni/Fe hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit  31.76 
 
 
267 aa  162  7e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0256  formate dehydrogenase beta subunit  31.76 
 
 
267 aa  162  7e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.77 
 
 
731 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2406  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.19 
 
 
370 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0152332 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1869  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.13 
 
 
731 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.856186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2087  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  35.4 
 
 
731 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1199  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.32 
 
 
263 aa  156  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.54 
 
 
300 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.393314  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1871  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.8 
 
 
300 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2601  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.33 
 
 
261 aa  153  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.75 
 
 
244 aa  152  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0528113  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2007  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34.24 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0462  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.72 
 
 
261 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3387  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.98 
 
 
281 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0169  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.46 
 
 
262 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.875219  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0778  formate dehydrogenase, iron-sulfur subunit  34.57 
 
 
277 aa  149  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0291  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.9 
 
 
253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.105514  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1705  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.39 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.295488  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1043  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.08 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1060  formate dehydrogenase beta subunit  35.51 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0770769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.67 
 
 
729 aa  146  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3653  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.5 
 
 
307 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00120014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0665  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.1 
 
 
302 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.73 
 
 
278 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0678  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.5 
 
 
302 aa  142  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000723832 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2266  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.82 
 
 
279 aa  142  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2039  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.21 
 
 
367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1579  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.23 
 
 
262 aa  136  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4620  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.39 
 
 
258 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4519  formate dehydrogenase, beta subunit  34.67 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6559  formate dehydrogenase, beta subunit  28.28 
 
 
310 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00146012  hitchhiker  0.00275448 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21830  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  29.88 
 
 
296 aa  126  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0866582 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2552  formate dehydrogenase beta subunit  35.64 
 
 
310 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1334  formate dehydrogenase, beta subunit  32.72 
 
 
302 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0798  formate dehydrogenase iron-sulfur subunit  31.22 
 
 
266 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4362  formate dehydrogenase-O iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
300 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03778  formate dehydrogenase-O, Fe-S subunit  31.97 
 
 
300 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4372  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  31.97 
 
 
300 aa  122  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4091  formate dehydrogenase, beta subunit  31.97 
 
 
300 aa  122  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03727  hypothetical protein  31.97 
 
 
300 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5343  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  31.97 
 
 
300 aa  122  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.82838 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4422  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  31.97 
 
 
300 aa  122  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4125  formate dehydrogenase, beta subunit  31.97 
 
 
300 aa  122  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4279  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  31.97 
 
 
300 aa  122  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4121  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  31.97 
 
 
300 aa  122  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4316  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
300 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4271  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
300 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4249  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
300 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.896409  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4427  formate dehydrogenase-O, iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
300 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0490  formate dehydrogenase, beta subunit  29.82 
 
 
316 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.373896 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2518  formate dehydrogenase, beta subunit  34.17 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.583749  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2661  formate dehydrogenase, beta subunit  33.17 
 
 
302 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.577915  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0524  formate dehydrogenase, beta subunit  29.82 
 
 
316 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1428  formate dehydrogenase, beta subunit  34.67 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2053  formate dehydrogenase beta subunit  36.92 
 
 
294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1817  formate dehydrogenase beta subunit  35.03 
 
 
295 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.814404  normal  0.117149 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1681  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.33 
 
 
307 aa  120  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.175927  normal  0.368411 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1751  formate dehydrogenase beta subunit  33.5 
 
 
295 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.587203  hitchhiker  0.00082122 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01445  hypothetical protein  34.9 
 
 
294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4086  formate dehydrogenase beta subunit  32.42 
 
 
307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.681709  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>