More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1199 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1199  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
263 aa  549  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0291  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  54.58 
 
 
253 aa  266  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.105514  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0169  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.08 
 
 
262 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.875219  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0462  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.74 
 
 
261 aa  248  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.44 
 
 
269 aa  241  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1043  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.47 
 
 
280 aa  240  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4620  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.44 
 
 
258 aa  238  8e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3387  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.71 
 
 
281 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2266  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.58 
 
 
279 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.92 
 
 
278 aa  231  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1060  formate dehydrogenase beta subunit  43.14 
 
 
277 aa  229  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0770769 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.69 
 
 
244 aa  228  6e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0528113  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0778  formate dehydrogenase, iron-sulfur subunit  42.35 
 
 
277 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2251  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.69 
 
 
353 aa  219  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000010611  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2087  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  39.86 
 
 
731 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.21 
 
 
731 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1869  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.86 
 
 
731 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.856186  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3042  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.42 
 
 
744 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1579  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.75 
 
 
262 aa  215  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0876  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.3 
 
 
352 aa  210  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.44 
 
 
729 aa  210  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.21 
 
 
352 aa  209  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.44 
 
 
372 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2406  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.91 
 
 
370 aa  207  9e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0152332 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0678  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.62 
 
 
302 aa  202  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000723832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2601  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.85 
 
 
261 aa  202  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0665  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
302 aa  201  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_122  Ni/Fe hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit  40.23 
 
 
267 aa  201  9e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2944  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.47 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.308792  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0256  formate dehydrogenase beta subunit  39.85 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0112  [Ni/Fe] hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit, putative  39.85 
 
 
267 aa  199  5e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.240975  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1800  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.38 
 
 
295 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.51699  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0652  hypothetical protein  39.92 
 
 
367 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3653  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.22 
 
 
307 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00120014  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0783  hydrogenase 2 protein HybA  39.64 
 
 
305 aa  194  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.311575  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3138  hydrogenase 2 protein HybA  38.11 
 
 
309 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1124  hydrogenase 2 protein HybA  38.11 
 
 
309 aa  192  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1705  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.03 
 
 
302 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.295488  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0145  hydrogenase 2 protein HybA  40.98 
 
 
313 aa  189  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2007  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  41.86 
 
 
298 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1871  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.09 
 
 
300 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.09 
 
 
300 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.393314  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4238  hydrogenase 2 protein HybA  40.98 
 
 
308 aa  186  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3522  hydrogenase 2 protein HybA  41.81 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.43405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1944  hydrogenase 2 protein HybA  36.6 
 
 
311 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.422273  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2039  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.46 
 
 
367 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2533  hydrogenase 2 protein HybA  33.89 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.412002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0525  hydrogenase 2 protein HybA  35.69 
 
 
316 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4089  hydrogenase 2 protein HybA  35.89 
 
 
331 aa  159  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.224971  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1411  hydrogenase 2 protein HybA  33.45 
 
 
338 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0513  hydrogenase 2 protein HybA  36.74 
 
 
317 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0508  hydrogenase 2 protein HybA  35.07 
 
 
317 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2505  hydrogenase 2 protein HybA  32.32 
 
 
340 aa  156  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.13164 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02872  hydrogenase 2 4Fe-4S ferredoxin-type component  33 
 
 
328 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33 
 
 
328 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4308  hydrogenase 2 protein HybA  33 
 
 
328 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02821  hypothetical protein  33 
 
 
328 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3282  hydrogenase 2 protein HybA  33 
 
 
328 aa  153  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3423  hydrogenase 2 protein HybA  33 
 
 
328 aa  153  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3465  hydrogenase 2 protein HybA  33 
 
 
328 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0480  hydrogenase 2 protein HybA  35.98 
 
 
317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0697  hydrogenase 2 protein HybA  33 
 
 
328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3176  hydrogenase 2 protein HybA  31.85 
 
 
328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0085  formate dehydrogenase, beta subunit  41.28 
 
 
299 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01433  formate dehydrogenase-N, Fe-S (beta) subunit, nitrate-inducible  38.71 
 
 
294 aa  148  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2172  formate dehydrogenase, beta subunit  38.71 
 
 
294 aa  148  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.402414  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01445  hypothetical protein  38.71 
 
 
294 aa  148  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2182  formate dehydrogenase, beta subunit  38.71 
 
 
294 aa  148  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1657  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  38.71 
 
 
294 aa  148  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1699  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  38.71 
 
 
294 aa  149  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.808171  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1558  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  38.71 
 
 
294 aa  148  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0545  formate dehydrogenase, beta subunit  38.17 
 
 
318 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.130453 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1285  formate dehydrogenase, beta subunit  40.89 
 
 
302 aa  148  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.519399  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1738  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  38.71 
 
 
294 aa  148  9e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213918  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3973  hydrogenase 2 protein HybA  32.8 
 
 
351 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.253471  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2087  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  38.71 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2518  formate dehydrogenase, beta subunit  38.71 
 
 
300 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.583749  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0533  formate dehydrogenase, beta subunit  37.4 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0490  formate dehydrogenase, beta subunit  37.4 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.373896 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1334  formate dehydrogenase, beta subunit  38.71 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1774  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  37.33 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0796568  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1683  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  37.33 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1596  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  37.33 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1746  formate dehydrogenase iron-sulfur subunit  37.33 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.644795  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1685  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  37.33 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2053  formate dehydrogenase beta subunit  37.44 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0524  formate dehydrogenase, beta subunit  37.4 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4086  formate dehydrogenase beta subunit  39.63 
 
 
307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.681709  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0798  formate dehydrogenase iron-sulfur subunit  34.72 
 
 
266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1428  formate dehydrogenase, beta subunit  38.53 
 
 
300 aa  145  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2661  formate dehydrogenase, beta subunit  39.9 
 
 
302 aa  145  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.577915  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3046  formate dehydrogenase, beta subunit  38.92 
 
 
302 aa  145  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2699  formate dehydrogenase beta subunit  38.36 
 
 
311 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5530  nitrate-inducible formate dehydrogenase subunit beta  35.97 
 
 
309 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1209  formate dehydrogenase, iron-sulfur subunit  36.65 
 
 
290 aa  143  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.796434  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0102  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, iron-sulfur subunit  38.42 
 
 
304 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0103  formate dehydrogenase beta subunit  38.42 
 
 
304 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0098  formate dehydrogenase beta subunit  38.42 
 
 
304 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0103  formate dehydrogenase beta subunit  38.42 
 
 
304 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3373  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.86 
 
 
258 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>