53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0978 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0978  copper amine oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  290  7e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  32.35 
 
 		 452 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  32.37 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  35.51 
 
 		 483 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  30.48 
 
 		 480 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  32.41 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  35 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 		 1305 aa  57  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  28.7 
 
 		 535 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  26.57 
 
 		 591 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.35 
 
 		 907 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  30.77 
 
 		 495 aa  54.3  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  30.28 
 
 		 478 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  31.73 
 
 		 352 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  27.41 
 
 		 481 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  24.48 
 
 		 418 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1055  copper amine oxidase domain-containing protein  30.47 
 
 		 541 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000877953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  21.97 
 
 		 451 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3230  copper amine oxidase domain protein  26.87 
 
 		 299 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.41019  normal  0.147437 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2746  copper amine oxidase domain-containing protein  30.43 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  30.53 
 
 		 456 aa  50.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  33.77 
 
 		 521 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  30 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  26.72 
 
 		 502 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  29.07 
 
 		 266 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  29.07 
 
 		 267 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  30 
 
 		 553 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3142  copper amine oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 746 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0524  copper amine oxidase domain protein  35.96 
 
 		 304 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  29.35 
 
 		 214 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  26.28 
 
 		 259 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  29.79 
 
 		 423 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  27.91 
 
 		 262 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2367  copper amine oxidase-like  34.62 
 
 		 249 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0176412  decreased coverage  0.00000016628 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  25 
 
 		 948 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  27.41 
 
 		 450 aa  44.7  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.6 
 
 		 431 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  26.05 
 
 		 282 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0892  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 239 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0596702  hitchhiker  0.0000457584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.77 
 
 		 657 aa  43.5  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2083  copper amine oxidase-like  29.17 
 
 		 763 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  27.78 
 
 		 323 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  25.34 
 
 		 331 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1942  copper amine oxidase domain protein  29.31 
 
 		 480 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  29.73 
 
 		 549 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  25.9 
 
 		 281 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1371  copper amine oxidase domain protein  27.27 
 
 		 531 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000791352  hitchhiker  0.00000351269 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  27.1 
 
 		 182 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  25.78 
 
 		 323 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0384  copper amine oxidase domain-containing protein  28.46 
 
 		 206 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  27.72 
 
 		 263 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  27 
 
 		 292 aa  41.2  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  26.6 
 
 		 474 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>