44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3425 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3425  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  474  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00373328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1179  protein of unknown function DUF540  38.27 
 
 		 258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.545793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2144  transmembrane protein  31.36 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1878  transmembrane protein  29.61 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2170  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.642596 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2152  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367401  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5925  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2065  hypothetical protein  37.98 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1119  hypothetical protein  32.14 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679333  normal  0.691739 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1527  hypothetical protein  31.98 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.185091  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2694  hypothetical protein  31.98 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3064  hypothetical protein  31.98 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2256  hypothetical protein  31.98 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1746  hypothetical protein  31.98 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.239959  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2773  hypothetical protein  31.98 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1484  hypothetical protein  29.24 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1255  hypothetical protein  35.4 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2189  hypothetical protein  32.74 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2638  hypothetical protein  31.4 
 
 		 365 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119622  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2062  hypothetical protein  32.94 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1083  putative transmembrane protein  32.92 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.677666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5461  hypothetical protein  32.14 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1175  hypothetical protein  32.92 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1518  hypothetical protein  28.82 
 
 		 277 aa  72  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507062  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2618  hypothetical protein  28.65 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0275442  normal  0.821137 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1841  hypothetical protein  29.65 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0232148  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3156  putative transmembrane protein  31.87 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0694  putative transmembrane protein  26.96 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.815168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2061  transmembrane protein  35.66 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1187  putative transmembrane protein  28.98 
 
 		 300 aa  52.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.465858 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1440  putative transmembrane protein  31.09 
 
 		 297 aa  52.8  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1107  putative transmembrane protein  28.98 
 
 		 300 aa  52.8  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1257  putative transmembrane protein  29.31 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.243356  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5004  putative transmembrane protein  28.03 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.786867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2977  putative transmembrane protein  29.76 
 
 		 298 aa  49.3  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0150  hypothetical protein  29.96 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660436  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2782  putative transmembrane protein  27.06 
 
 		 302 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262612 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3841  CysZ-like protein  29.41 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3579  hypothetical protein  33.04 
 
 		 298 aa  43.5  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1630  putative transmembrane protein  32.41 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0756138  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4022  CysZ-like protein  28.57 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0167  CysZ-like protein  28.32 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0177  CysZ-like protein  29.41 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3442  CysZ-like protein  31.11 
 
 		 237 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>