40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0167 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0167  CysZ-like protein  100 
 
 
237 aa  464  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0160  CysZ-like protein  99.16 
 
 
237 aa  457  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0177  CysZ-like protein  82.48 
 
 
242 aa  351  5e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4022  CysZ-like protein  65.37 
 
 
243 aa  291  8e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3442  CysZ-like protein  62.34 
 
 
237 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3744  CysZ-like protein  61.9 
 
 
237 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3841  CysZ-like protein  61.43 
 
 
235 aa  246  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3414  CysZ-like protein  63.2 
 
 
250 aa  241  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1350  CysZ-like protein  50.44 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0573  hypothetical protein  47.21 
 
 
241 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0583  protein of unknown function DUF540  46.78 
 
 
241 aa  204  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0547  protein of unknown function DUF540  47.19 
 
 
239 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0368  protein of unknown function DUF540  45.92 
 
 
238 aa  187  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141311  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0441  CysZ-like protein  45.73 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0205  CysZ-like protein  44.44 
 
 
250 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0060  CysZ-like protein  44.87 
 
 
246 aa  178  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29129  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2691  hypothetical protein  43.1 
 
 
233 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0238338  normal  0.25801 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0068  CysZ-like protein  44.02 
 
 
246 aa  175  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0474  CysZ-like protein  43.16 
 
 
248 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0349  CysZ-like protein  43.16 
 
 
247 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317609  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0378  CysZ-like protein  43.72 
 
 
249 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.953327  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1152  hypothetical protein  43.97 
 
 
237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2241  hypothetical protein  43.4 
 
 
238 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00757602  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3566  hypothetical protein  39.13 
 
 
226 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0151  protein of unknown function DUF540  43.52 
 
 
240 aa  129  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.236012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1307  hypothetical protein  37.13 
 
 
231 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0150  hypothetical protein  37.18 
 
 
227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660436  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2467  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.29772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0810  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0694  hypothetical protein  35.22 
 
 
230 aa  108  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.444998  normal  0.0165633 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0370  hypothetical protein  39.2 
 
 
231 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775974  normal  0.439004 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3162  hypothetical protein  35.54 
 
 
237 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2628  hypothetical protein  32.77 
 
 
236 aa  97.1  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.0429489 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2176  hypothetical protein  34.03 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4648  hypothetical protein  32.84 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3425  hypothetical protein  28.32 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00373328  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3189  protein of unknown function DUF540  23.7 
 
 
256 aa  42.7  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000074726  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2227  protein of unknown function DUF540  23 
 
 
241 aa  42  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0886  putative sulfate transport protein CysZ  22.48 
 
 
250 aa  42  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2144  transmembrane protein  29.33 
 
 
240 aa  42  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>