50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1179 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1179  protein of unknown function DUF540  100 
 
 		 258 aa  503  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.545793  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3425  hypothetical protein  38.27 
 
 		 244 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00373328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2144  transmembrane protein  36.55 
 
 		 240 aa  125  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1878  transmembrane protein  35.51 
 
 		 261 aa  125  9e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1484  hypothetical protein  36.16 
 
 		 289 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2618  hypothetical protein  31.73 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0275442  normal  0.821137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1518  hypothetical protein  30.94 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507062  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1841  hypothetical protein  33.8 
 
 		 344 aa  102  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0232148  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2638  hypothetical protein  31.82 
 
 		 365 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2694  hypothetical protein  31.78 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1527  hypothetical protein  31.78 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.185091  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2256  hypothetical protein  31.78 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2773  hypothetical protein  31.48 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1746  hypothetical protein  31.78 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.239959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3064  hypothetical protein  31.78 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2170  hypothetical protein  28.78 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.642596 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5925  hypothetical protein  28.78 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2152  hypothetical protein  28.78 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367401  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2065  hypothetical protein  29.07 
 
 		 291 aa  95.9  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1255  hypothetical protein  27.65 
 
 		 285 aa  95.9  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5461  hypothetical protein  29.15 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1119  hypothetical protein  27.68 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679333  normal  0.691739 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2062  hypothetical protein  28.41 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2189  hypothetical protein  28.04 
 
 		 275 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1257  putative transmembrane protein  26.64 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.243356  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1083  putative transmembrane protein  30.19 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.677666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1175  hypothetical protein  30.19 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0694  putative transmembrane protein  25.09 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.815168 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1107  putative transmembrane protein  30.04 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1187  putative transmembrane protein  30.04 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.465858 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1440  putative transmembrane protein  30.35 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2782  putative transmembrane protein  31.46 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262612 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3579  hypothetical protein  30.84 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2061  transmembrane protein  28.42 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2078  hypothetical protein  30.42 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2977  putative transmembrane protein  28.81 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3156  putative transmembrane protein  32.16 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1805  putative transmembrane protein  30.77 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000250294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5004  putative transmembrane protein  30 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.786867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1630  putative transmembrane protein  30.33 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0756138  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0150  hypothetical protein  37.23 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660436  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0441  CysZ-like protein  29.53 
 
 		 251 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3566  hypothetical protein  27.81 
 
 		 226 aa  46.2  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0177  CysZ-like protein  27.7 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1350  CysZ-like protein  25.41 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0060  CysZ-like protein  29.01 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29129  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0378  CysZ-like protein  27.95 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.953327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0068  CysZ-like protein  28.86 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0474  CysZ-like protein  26.79 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0167  CysZ-like protein  30.05 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>