40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5461 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5461  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2170  hypothetical protein  95.64 
 
 
275 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.642596 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2152  hypothetical protein  95.64 
 
 
275 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367401  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5925  hypothetical protein  95.64 
 
 
275 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1119  hypothetical protein  92 
 
 
275 aa  481  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679333  normal  0.691739 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2189  hypothetical protein  93.82 
 
 
275 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2062  hypothetical protein  93.45 
 
 
275 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2638  hypothetical protein  79.25 
 
 
365 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2773  hypothetical protein  79.93 
 
 
296 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1841  hypothetical protein  79.73 
 
 
344 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0232148  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3064  hypothetical protein  81.92 
 
 
277 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2256  hypothetical protein  81.92 
 
 
277 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2694  hypothetical protein  81.92 
 
 
277 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1527  hypothetical protein  81.92 
 
 
277 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.185091  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1746  hypothetical protein  81.92 
 
 
277 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.239959  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1484  hypothetical protein  68.3 
 
 
289 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2618  hypothetical protein  65.92 
 
 
277 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0275442  normal  0.821137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1518  hypothetical protein  65.92 
 
 
277 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507062  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1255  hypothetical protein  52.69 
 
 
285 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2065  hypothetical protein  52.71 
 
 
291 aa  281  9e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1175  hypothetical protein  53.58 
 
 
285 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1083  putative transmembrane protein  52.83 
 
 
285 aa  269  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.677666  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2061  transmembrane protein  54.28 
 
 
291 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1257  putative transmembrane protein  41.39 
 
 
289 aa  232  7.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.243356  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0694  putative transmembrane protein  42.44 
 
 
289 aa  231  8.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.815168 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2078  hypothetical protein  46.07 
 
 
291 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2782  putative transmembrane protein  43.87 
 
 
302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262612 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1805  putative transmembrane protein  43.91 
 
 
308 aa  196  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000250294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3579  hypothetical protein  41.22 
 
 
298 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1187  putative transmembrane protein  40.07 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.465858 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1107  putative transmembrane protein  40.07 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3156  putative transmembrane protein  42.48 
 
 
271 aa  169  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2977  putative transmembrane protein  41.48 
 
 
298 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1630  putative transmembrane protein  44.69 
 
 
294 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0756138  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5004  putative transmembrane protein  39.7 
 
 
295 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.786867  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1440  putative transmembrane protein  37.73 
 
 
297 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2144  transmembrane protein  30.04 
 
 
240 aa  90.9  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1179  protein of unknown function DUF540  31.77 
 
 
258 aa  90.5  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.545793  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3425  hypothetical protein  33.14 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00373328  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1878  transmembrane protein  28.36 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>