41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1805 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1805  putative transmembrane protein  100 
 
 		 308 aa  603  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000250294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2782  putative transmembrane protein  73.31 
 
 		 302 aa  383  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262612 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1107  putative transmembrane protein  57.39 
 
 		 300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1187  putative transmembrane protein  61.11 
 
 		 300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.465858 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2977  putative transmembrane protein  61.4 
 
 		 298 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3156  putative transmembrane protein  61.85 
 
 		 271 aa  299  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2078  hypothetical protein  59.26 
 
 		 291 aa  292  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1440  putative transmembrane protein  55.81 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5004  putative transmembrane protein  54.09 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.786867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3579  hypothetical protein  53.58 
 
 		 298 aa  245  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1630  putative transmembrane protein  59.11 
 
 		 294 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0756138  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1255  hypothetical protein  41.81 
 
 		 285 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1119  hypothetical protein  43.17 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679333  normal  0.691739 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1484  hypothetical protein  42.64 
 
 		 289 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5925  hypothetical protein  43.17 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2152  hypothetical protein  43.17 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2170  hypothetical protein  43.17 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.642596 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2065  hypothetical protein  42.25 
 
 		 291 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1841  hypothetical protein  44.49 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0232148  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2638  hypothetical protein  43.84 
 
 		 365 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119622  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1746  hypothetical protein  43.48 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.239959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1527  hypothetical protein  43.48 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.185091  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2694  hypothetical protein  43.48 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2256  hypothetical protein  43.48 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3064  hypothetical protein  43.48 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2773  hypothetical protein  43.48 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5461  hypothetical protein  43.91 
 
 		 298 aa  215  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2062  hypothetical protein  44.28 
 
 		 275 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2618  hypothetical protein  40.07 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0275442  normal  0.821137 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2061  transmembrane protein  43.33 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1518  hypothetical protein  39.35 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507062  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2189  hypothetical protein  43.91 
 
 		 275 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1175  hypothetical protein  42.8 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1083  putative transmembrane protein  42.42 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.677666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0694  putative transmembrane protein  38.72 
 
 		 289 aa  192  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.815168 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1257  putative transmembrane protein  37.59 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.243356  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2144  transmembrane protein  34.13 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1878  transmembrane protein  35.25 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3425  hypothetical protein  28.48 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00373328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1179  protein of unknown function DUF540  36.21 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.545793  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3900  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.76 
 
 		 488 aa  46.2  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.362136  normal  0.120633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>