40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2065 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2065  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2061  transmembrane protein  81.79 
 
 		 291 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1255  hypothetical protein  60.35 
 
 		 285 aa  347  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1083  putative transmembrane protein  59.23 
 
 		 285 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.677666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1175  hypothetical protein  59.23 
 
 		 285 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1518  hypothetical protein  55.07 
 
 		 277 aa  298  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507062  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2618  hypothetical protein  55.07 
 
 		 277 aa  298  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0275442  normal  0.821137 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1484  hypothetical protein  52.83 
 
 		 289 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2170  hypothetical protein  53.16 
 
 		 275 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.642596 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2152  hypothetical protein  53.16 
 
 		 275 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367401  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5925  hypothetical protein  53.16 
 
 		 275 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1119  hypothetical protein  53.56 
 
 		 275 aa  285  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679333  normal  0.691739 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2638  hypothetical protein  54.28 
 
 		 365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1841  hypothetical protein  52.48 
 
 		 344 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0232148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1527  hypothetical protein  52.48 
 
 		 277 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.185091  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1746  hypothetical protein  52.48 
 
 		 277 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.239959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2694  hypothetical protein  52.48 
 
 		 277 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3064  hypothetical protein  52.48 
 
 		 277 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2256  hypothetical protein  52.48 
 
 		 277 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2773  hypothetical protein  53.9 
 
 		 296 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2189  hypothetical protein  53.9 
 
 		 275 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5461  hypothetical protein  52.79 
 
 		 298 aa  275  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2062  hypothetical protein  53.53 
 
 		 275 aa  275  8e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0694  putative transmembrane protein  49.62 
 
 		 289 aa  256  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.815168 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1257  putative transmembrane protein  46.1 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.243356  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1805  putative transmembrane protein  41.41 
 
 		 308 aa  201  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000250294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2782  putative transmembrane protein  42.11 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262612 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2078  hypothetical protein  41.73 
 
 		 291 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2977  putative transmembrane protein  41.67 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3579  hypothetical protein  40.38 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1107  putative transmembrane protein  38.97 
 
 		 300 aa  171  9e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1187  putative transmembrane protein  38.97 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.465858 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3156  putative transmembrane protein  40 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5004  putative transmembrane protein  37.28 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.786867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1630  putative transmembrane protein  40.28 
 
 		 294 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0756138  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1440  putative transmembrane protein  34.98 
 
 		 297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1878  transmembrane protein  32.36 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2144  transmembrane protein  28.57 
 
 		 240 aa  89.7  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3425  hypothetical protein  37.98 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00373328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1179  protein of unknown function DUF540  29.33 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.545793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>