40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1255 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1255  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  552  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1175  hypothetical protein  75.87 
 
 		 285 aa  394  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1083  putative transmembrane protein  75.52 
 
 		 285 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.677666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2065  hypothetical protein  61.87 
 
 		 291 aa  335  3.9999999999999995e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2061  transmembrane protein  60.63 
 
 		 291 aa  308  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1484  hypothetical protein  57.95 
 
 		 289 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2170  hypothetical protein  54.12 
 
 		 275 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.642596 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2152  hypothetical protein  54.12 
 
 		 275 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367401  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5925  hypothetical protein  54.12 
 
 		 275 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1518  hypothetical protein  56.82 
 
 		 277 aa  299  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507062  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2618  hypothetical protein  56.82 
 
 		 277 aa  298  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0275442  normal  0.821137 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1119  hypothetical protein  53.9 
 
 		 275 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679333  normal  0.691739 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1841  hypothetical protein  54.34 
 
 		 344 aa  287  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0232148  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5461  hypothetical protein  52.69 
 
 		 298 aa  285  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2062  hypothetical protein  53.05 
 
 		 275 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2189  hypothetical protein  53.05 
 
 		 275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1746  hypothetical protein  53.21 
 
 		 277 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.239959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1527  hypothetical protein  53.21 
 
 		 277 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.185091  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2694  hypothetical protein  53.21 
 
 		 277 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3064  hypothetical protein  53.21 
 
 		 277 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2256  hypothetical protein  53.21 
 
 		 277 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2638  hypothetical protein  53.58 
 
 		 365 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2773  hypothetical protein  53.21 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1257  putative transmembrane protein  40.71 
 
 		 289 aa  244  9e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.243356  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0694  putative transmembrane protein  40.71 
 
 		 289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.815168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2782  putative transmembrane protein  43.51 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262612 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1805  putative transmembrane protein  41.81 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000250294 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2977  putative transmembrane protein  44.18 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2078  hypothetical protein  41.64 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3579  hypothetical protein  39.78 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3156  putative transmembrane protein  40.15 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1107  putative transmembrane protein  39.63 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1187  putative transmembrane protein  39.63 
 
 		 300 aa  169  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.465858 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5004  putative transmembrane protein  41.73 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.786867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1630  putative transmembrane protein  43.56 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0756138  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1440  putative transmembrane protein  37.68 
 
 		 297 aa  158  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1878  transmembrane protein  29.09 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1179  protein of unknown function DUF540  30.29 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.545793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2144  transmembrane protein  27.78 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3425  hypothetical protein  35.4 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00373328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>