40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2782 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2782  putative transmembrane protein  100 
 
 		 302 aa  589  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262612 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1805  putative transmembrane protein  73.31 
 
 		 308 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000250294 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2977  putative transmembrane protein  60.42 
 
 		 298 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1107  putative transmembrane protein  59.02 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1187  putative transmembrane protein  59.4 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.465858 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2078  hypothetical protein  57.25 
 
 		 291 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3156  putative transmembrane protein  60.15 
 
 		 271 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1440  putative transmembrane protein  51.52 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5004  putative transmembrane protein  51.61 
 
 		 295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.786867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3579  hypothetical protein  52.47 
 
 		 298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1630  putative transmembrane protein  59.85 
 
 		 294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0756138  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1119  hypothetical protein  44.57 
 
 		 275 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679333  normal  0.691739 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5925  hypothetical protein  43.87 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2170  hypothetical protein  43.87 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.642596 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2152  hypothetical protein  43.87 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367401  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2062  hypothetical protein  44.61 
 
 		 275 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1518  hypothetical protein  42.28 
 
 		 277 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507062  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1484  hypothetical protein  42.37 
 
 		 289 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1255  hypothetical protein  43.18 
 
 		 285 aa  223  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2618  hypothetical protein  42.28 
 
 		 277 aa  222  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0275442  normal  0.821137 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2189  hypothetical protein  43.87 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5461  hypothetical protein  43.87 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1841  hypothetical protein  44.27 
 
 		 344 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0232148  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2061  transmembrane protein  44.21 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2638  hypothetical protein  43.51 
 
 		 365 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119622  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1746  hypothetical protein  42.24 
 
 		 277 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.239959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1527  hypothetical protein  42.24 
 
 		 277 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.185091  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2694  hypothetical protein  42.24 
 
 		 277 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3064  hypothetical protein  42.24 
 
 		 277 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2256  hypothetical protein  42.24 
 
 		 277 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2773  hypothetical protein  42.24 
 
 		 296 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2065  hypothetical protein  42.25 
 
 		 291 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1175  hypothetical protein  41.7 
 
 		 285 aa  209  7e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1083  putative transmembrane protein  41.7 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.677666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0694  putative transmembrane protein  37.85 
 
 		 289 aa  189  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.815168 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1257  putative transmembrane protein  36.86 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.243356  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2144  transmembrane protein  30.77 
 
 		 240 aa  99  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1878  transmembrane protein  27.65 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1179  protein of unknown function DUF540  36.29 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.545793  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3425  hypothetical protein  27.06 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00373328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>