43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2144 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2144  transmembrane protein  100 
 
 		 240 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1878  transmembrane protein  60.67 
 
 		 261 aa  271  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1179  protein of unknown function DUF540  36.55 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.545793  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3425  hypothetical protein  31.36 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00373328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1805  putative transmembrane protein  32.14 
 
 		 308 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000250294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2782  putative transmembrane protein  29.96 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262612 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2065  hypothetical protein  29.78 
 
 		 291 aa  88.6  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3156  putative transmembrane protein  37.74 
 
 		 271 aa  85.1  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2170  hypothetical protein  30.77 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.642596 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2152  hypothetical protein  30.77 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367401  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5925  hypothetical protein  30.77 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1518  hypothetical protein  32.58 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507062  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1257  putative transmembrane protein  28.83 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.243356  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1119  hypothetical protein  30.43 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679333  normal  0.691739 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2618  hypothetical protein  32.13 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0275442  normal  0.821137 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0694  putative transmembrane protein  29.34 
 
 		 289 aa  82  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.815168 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1107  putative transmembrane protein  30.28 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1187  putative transmembrane protein  30.68 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.465858 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2189  hypothetical protein  31.5 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5461  hypothetical protein  30.04 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1255  hypothetical protein  27.78 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2062  hypothetical protein  30.77 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1841  hypothetical protein  33.03 
 
 		 344 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0232148  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2977  putative transmembrane protein  30.51 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2061  transmembrane protein  27.86 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2773  hypothetical protein  31.67 
 
 		 296 aa  72  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1484  hypothetical protein  29.2 
 
 		 289 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1083  putative transmembrane protein  31.37 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.677666  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1746  hypothetical protein  31.67 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.239959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1527  hypothetical protein  31.67 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.185091  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2694  hypothetical protein  31.67 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3064  hypothetical protein  31.67 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2256  hypothetical protein  31.67 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1175  hypothetical protein  31.37 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2638  hypothetical protein  31.67 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119622  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3579  hypothetical protein  31.58 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2078  hypothetical protein  34.54 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0150  hypothetical protein  33.54 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660436  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1440  putative transmembrane protein  31.89 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5004  putative transmembrane protein  34.34 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.786867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1630  putative transmembrane protein  30.56 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0756138  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3566  hypothetical protein  30.53 
 
 		 226 aa  46.6  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0440  hypothetical protein  23.36 
 
 		 250 aa  41.6  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>