37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0150 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0150  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660436  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2467  hypothetical protein  34.96 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.29772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0810  hypothetical protein  34.96 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0694  hypothetical protein  33.92 
 
 		 230 aa  134  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.444998  normal  0.0165633 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0370  hypothetical protein  36.89 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775974  normal  0.439004 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2628  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  121  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.0429489 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4022  CysZ-like protein  38.99 
 
 		 243 aa  121  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0441  CysZ-like protein  32.92 
 
 		 251 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0573  hypothetical protein  36.91 
 
 		 241 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0474  CysZ-like protein  32.64 
 
 		 248 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0378  CysZ-like protein  33.47 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.953327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0583  protein of unknown function DUF540  36.91 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3566  hypothetical protein  38.94 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3442  CysZ-like protein  34.87 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0547  protein of unknown function DUF540  36.84 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0349  CysZ-like protein  32.22 
 
 		 247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317609  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0205  CysZ-like protein  31.95 
 
 		 250 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3841  CysZ-like protein  40.56 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0068  CysZ-like protein  32.08 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3162  hypothetical protein  32.46 
 
 		 237 aa  106  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0368  protein of unknown function DUF540  41.25 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141311  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0060  CysZ-like protein  31.25 
 
 		 246 aa  104  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29129  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_004310  BR0167  CysZ-like protein  42.86 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0177  CysZ-like protein  40.13 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2691  hypothetical protein  38.92 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0238338  normal  0.25801 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0160  CysZ-like protein  40.85 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1152  hypothetical protein  38.12 
 
 		 237 aa  95.9  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2241  hypothetical protein  36.89 
 
 		 238 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00757602  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3744  CysZ-like protein  37.84 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3414  CysZ-like protein  35.02 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1350  CysZ-like protein  33.96 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1307  hypothetical protein  33.04 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2176  hypothetical protein  30 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0151  protein of unknown function DUF540  35.59 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.236012 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2144  transmembrane protein  33.54 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4648  hypothetical protein  32.94 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3425  hypothetical protein  29.96 
 
 		 244 aa  48.5  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00373328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>