79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0107 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0107  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  304  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2690  hypothetical protein  43.38 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2812  hypothetical protein  43.38 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2387  hypothetical protein  43.38 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1702  hypothetical protein  42.65 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.871926  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2900  hypothetical protein  42.65 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.272152  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2575  Sterol-binding domain protein  41.38 
 
 		 172 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0715  Sterol-binding domain protein  41.33 
 
 		 178 aa  100  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2747  hypothetical protein  42.65 
 
 		 159 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3222  hypothetical protein  41.38 
 
 		 172 aa  100  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1806  hypothetical protein  41.18 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0134  hypothetical protein  43.7 
 
 		 160 aa  89.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0595  Sterol-binding domain protein  46.81 
 
 		 174 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0819  Sterol-binding domain protein  43.62 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.470891  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03386  hypothetical protein  38.98 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002620  putative lipid carrier protein  38.98 
 
 		 175 aa  76.6  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2111  hypothetical protein  34.29 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.342906  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1787  hypothetical protein  34.78 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.017366  normal  0.582265 
 
 
-
 
NC_003296  RS02299  hypothetical protein  37.31 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394497 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0185  hypothetical protein  34.88 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4662  hypothetical protein  36.57 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3455  Sterol-binding domain protein  43.62 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.330652  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3594  sterol-binding domain-containing protein  42.55 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.820856  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3585  hypothetical protein  36.57 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.837033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3714  sterol-binding domain-containing protein  38.3 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3580  SCP-2 sterol transfer family protein  38.3 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4011  SCP-2 sterol transfer family protein  38.3 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4476  sterol-binding protein  40.43 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3349  sterol-binding protein  40.43 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3639  sterol-binding protein  40.43 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02975  hypothetical protein  40.43 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0541  sterol-binding domain-containing protein  40.43 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3452  sterol-binding protein  40.43 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0548  Sterol-binding domain protein  40.43 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03024  predicted lipid carrier protein  40.43 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3615  sterol-binding protein  37.14 
 
 		 174 aa  70.5  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2134  hypothetical protein  41.94 
 
 		 157 aa  70.1  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3462  sterol-binding protein  39.36 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3531  sterol-binding protein  39.36 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3568  sterol-binding protein  39.36 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3460  sterol-binding protein  39.36 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3628  sterol-binding protein  39.36 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.446971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0607  hypothetical protein  35.34 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1197  hypothetical protein  43.62 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.704152  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3336  Sterol-binding domain protein  38.3 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4938  hypothetical protein  41.75 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.409194 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0505  sterol-binding domain-containing protein  36.17 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2129  SCP-2 sterol transfer family protein  31.62 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13320  hypothetical protein  42.55 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.3654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03865  putative lipid carrier protein  46.67 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1040  hypothetical protein  35.37 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1134  sterol-binding domain-containing protein  43.01 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.245138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1062  sterol-binding domain-containing protein  43.01 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0999  hypothetical protein  41.41 
 
 		 170 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5058  hypothetical protein  36.64 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223601  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3339  sterol-binding domain-containing protein  40 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2183  hypothetical protein  33.09 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.688747  unclonable  0.000000231276 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2067  sterol-binding domain-containing protein  35.05 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3201  sterol-binding domain-containing protein  40 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3018  sterol-binding domain-containing protein  39.78 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3349  hypothetical protein  38.78 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1066  sterol-binding domain-containing protein  40.86 
 
 		 178 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2786  sterol-binding domain-containing protein  35.79 
 
 		 170 aa  60.1  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3195  sterol-binding domain-containing protein  38.95 
 
 		 177 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2804  sterol-binding domain-containing protein  39.78 
 
 		 178 aa  60.5  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1172  Sterol-binding domain protein  38.95 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1015  hypothetical protein  36.21 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3493  putative lipid carrier protein-like protein  34.59 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3090  sterol-binding domain-containing protein  39.76 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1250  hypothetical protein  40 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3515  sterol-binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2346  Putative lipid carrier protein-like protein  34.78 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.429272  hitchhiker  0.0000140967 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2724  hypothetical protein  34.78 
 
 		 204 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.342015  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1472  sterol-binding domain-containing protein  35.2 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119197 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1032  sterol-binding domain-containing protein  33.1 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.266214  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4227  hypothetical protein  45.45 
 
 		 177 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0466  hypothetical protein  43.14 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.978743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2118  hypothetical protein  43.14 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal  0.854449 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2387  putative lipid carrier protein-like protein  43.14 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0557516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>