75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0595 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0595  Sterol-binding domain protein  100 
 
 		 174 aa  351  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0819  Sterol-binding domain protein  95.98 
 
 		 191 aa  340  5.999999999999999e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.470891  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3455  Sterol-binding domain protein  81.61 
 
 		 174 aa  289  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.330652  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0505  sterol-binding domain-containing protein  80.46 
 
 		 173 aa  281  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3336  Sterol-binding domain protein  78.16 
 
 		 174 aa  280  6.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4011  SCP-2 sterol transfer family protein  75.29 
 
 		 173 aa  260  8e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3580  SCP-2 sterol transfer family protein  75.29 
 
 		 173 aa  260  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3714  sterol-binding domain-containing protein  74.71 
 
 		 200 aa  258  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3594  sterol-binding domain-containing protein  73.12 
 
 		 174 aa  243  6.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.820856  normal  0.0404231 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0548  Sterol-binding domain protein  71.88 
 
 		 174 aa  237  5.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02975  hypothetical protein  71.88 
 
 		 174 aa  237  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4476  sterol-binding protein  71.88 
 
 		 174 aa  237  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3452  sterol-binding protein  71.88 
 
 		 174 aa  237  5.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0541  sterol-binding domain-containing protein  71.88 
 
 		 174 aa  237  5.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3639  sterol-binding protein  71.88 
 
 		 174 aa  237  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3349  sterol-binding protein  71.88 
 
 		 174 aa  237  5.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03024  predicted lipid carrier protein  71.88 
 
 		 174 aa  237  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3615  sterol-binding protein  71.25 
 
 		 174 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3531  sterol-binding protein  67.9 
 
 		 174 aa  231  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3568  sterol-binding protein  67.9 
 
 		 174 aa  231  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3462  sterol-binding protein  67.9 
 
 		 174 aa  231  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3460  sterol-binding protein  67.9 
 
 		 174 aa  231  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3628  sterol-binding protein  67.9 
 
 		 174 aa  231  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.446971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0607  hypothetical protein  52.63 
 
 		 172 aa  184  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0185  hypothetical protein  53.42 
 
 		 175 aa  177  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03386  hypothetical protein  50.59 
 
 		 175 aa  177  9e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002620  putative lipid carrier protein  51.53 
 
 		 175 aa  174  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2129  SCP-2 sterol transfer family protein  46.36 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409969  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2786  sterol-binding domain-containing protein  44.74 
 
 		 170 aa  132  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1134  sterol-binding domain-containing protein  46.05 
 
 		 178 aa  130  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.245138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1062  sterol-binding domain-containing protein  46.36 
 
 		 178 aa  130  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1066  sterol-binding domain-containing protein  45.39 
 
 		 178 aa  129  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0999  hypothetical protein  44.67 
 
 		 170 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2804  sterol-binding domain-containing protein  43.79 
 
 		 178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3339  sterol-binding domain-containing protein  41.83 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3201  sterol-binding domain-containing protein  41.83 
 
 		 177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1172  Sterol-binding domain protein  41.83 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3195  sterol-binding domain-containing protein  41.83 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1015  hypothetical protein  43.87 
 
 		 165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3349  hypothetical protein  46.21 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3515  sterol-binding domain-containing protein  44.16 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3018  sterol-binding domain-containing protein  44.83 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1040  hypothetical protein  39.02 
 
 		 181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1250  hypothetical protein  45.03 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13320  hypothetical protein  49.15 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.3654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1197  hypothetical protein  49.15 
 
 		 167 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.704152  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2134  hypothetical protein  44.53 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2067  sterol-binding domain-containing protein  46.96 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03865  putative lipid carrier protein  36.13 
 
 		 194 aa  98.2  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1806  hypothetical protein  41.54 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1032  sterol-binding domain-containing protein  41.04 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.266214  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2747  hypothetical protein  41.67 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2812  hypothetical protein  42.31 
 
 		 159 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2690  hypothetical protein  42.31 
 
 		 159 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2387  hypothetical protein  42.31 
 
 		 159 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1702  hypothetical protein  41.54 
 
 		 159 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.871926  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2900  hypothetical protein  41.54 
 
 		 159 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.272152  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0107  hypothetical protein  46.81 
 
 		 151 aa  85.9  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2183  hypothetical protein  47.62 
 
 		 150 aa  84.3  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.688747  unclonable  0.000000231276 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3222  hypothetical protein  47.78 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2575  Sterol-binding domain protein  47.78 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0715  Sterol-binding domain protein  41.88 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2724  hypothetical protein  39.25 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.342015  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2346  Putative lipid carrier protein-like protein  39.25 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.429272  hitchhiker  0.0000140967 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0134  hypothetical protein  68.63 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02299  hypothetical protein  43.68 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394497 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3585  hypothetical protein  42.68 
 
 		 138 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.837033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4662  hypothetical protein  42.68 
 
 		 138 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3090  sterol-binding domain-containing protein  39.47 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2111  hypothetical protein  41.67 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.342906  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1787  hypothetical protein  41.67 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.017366  normal  0.582265 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4938  hypothetical protein  34.56 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.409194 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3493  putative lipid carrier protein-like protein  33.71 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5058  hypothetical protein  39.53 
 
 		 150 aa  51.6  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223601  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1472  sterol-binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119197 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>