57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0466 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2118  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  331  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal  0.854449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0466  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  331  4e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.978743  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2387  putative lipid carrier protein-like protein  97.13 
 
 		 174 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0557516 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4477  hypothetical protein  45.45 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.320227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4227  hypothetical protein  47.06 
 
 		 177 aa  110  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4327  hypothetical protein  46.21 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4780  hypothetical protein  45.74 
 
 		 180 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.472606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1002  hypothetical protein  45.8 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0291  hypothetical protein  43.31 
 
 		 174 aa  97.8  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0267  hypothetical protein  43.31 
 
 		 174 aa  97.8  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.708651  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3117  hypothetical protein  42.11 
 
 		 169 aa  90.1  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3474  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  84.3  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.498948  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3004  putative lipid carrier protein-like protein  41.86 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2400  putative lipid carrier protein-like protein  36.44 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6297  hypothetical protein  37.96 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3493  putative lipid carrier protein-like protein  29.8 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4295  putative lipid carrier protein-like  37.78 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2724  hypothetical protein  39.13 
 
 		 204 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.342015  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02299  hypothetical protein  34.11 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394497 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2067  sterol-binding domain-containing protein  26.36 
 
 		 153 aa  48.9  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2346  Putative lipid carrier protein-like protein  39.13 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.429272  hitchhiker  0.0000140967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1787  hypothetical protein  30.6 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.017366  normal  0.582265 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2111  hypothetical protein  30.6 
 
 		 141 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.342906  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3594  sterol-binding domain-containing protein  42.11 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.820856  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3585  hypothetical protein  32.35 
 
 		 138 aa  45.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.837033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1472  sterol-binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119197 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4662  hypothetical protein  32.35 
 
 		 138 aa  45.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3222  hypothetical protein  30.29 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2183  hypothetical protein  30.41 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.688747  unclonable  0.000000231276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2575  Sterol-binding domain protein  30.11 
 
 		 172 aa  45.1  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1197  hypothetical protein  32.58 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.704152  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0607  hypothetical protein  33.77 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1032  sterol-binding domain-containing protein  38.33 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.266214  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3090  sterol-binding domain-containing protein  36.71 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4938  hypothetical protein  38.89 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.409194 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2526  hypothetical protein  29.76 
 
 		 227 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0107  hypothetical protein  43.14 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03386  hypothetical protein  34.94 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13320  hypothetical protein  33.73 
 
 		 171 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.3654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3349  hypothetical protein  35.09 
 
 		 170 aa  42  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1040  hypothetical protein  40 
 
 		 181 aa  41.6  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002620  putative lipid carrier protein  36.07 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3615  sterol-binding protein  41.51 
 
 		 174 aa  40.8  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3531  sterol-binding protein  41.51 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3568  sterol-binding protein  41.51 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3462  sterol-binding protein  41.51 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3460  sterol-binding protein  41.51 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3628  sterol-binding protein  41.51 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.446971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3452  sterol-binding protein  41.51 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0541  sterol-binding domain-containing protein  41.51 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4476  sterol-binding protein  41.51 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3639  sterol-binding protein  41.51 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3349  sterol-binding protein  41.51 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0548  Sterol-binding domain protein  41.51 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02975  hypothetical protein  41.51 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03024  predicted lipid carrier protein  41.51 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2786  sterol-binding domain-containing protein  36.21 
 
 		 170 aa  40.8  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>