18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4295 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4295  putative lipid carrier protein-like  100 
 
 
183 aa  355  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3004  putative lipid carrier protein-like protein  47.2 
 
 
179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195226  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0291  hypothetical protein  47.93 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0267  hypothetical protein  47.93 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.708651  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3117  hypothetical protein  41.1 
 
 
169 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6297  hypothetical protein  43.45 
 
 
168 aa  92.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4477  hypothetical protein  45.95 
 
 
181 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.320227  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4327  hypothetical protein  44.95 
 
 
185 aa  91.3  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457545  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1002  hypothetical protein  44.04 
 
 
181 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4780  hypothetical protein  41.82 
 
 
180 aa  87.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.472606  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2400  putative lipid carrier protein-like protein  36.23 
 
 
190 aa  80.9  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4227  hypothetical protein  39.2 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2387  putative lipid carrier protein-like protein  37.78 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0557516 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2118  hypothetical protein  37.78 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal  0.854449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0466  hypothetical protein  37.78 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.978743  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3474  hypothetical protein  38.68 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.498948  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13320  hypothetical protein  32.03 
 
 
171 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.3654  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1197  hypothetical protein  30.92 
 
 
167 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.704152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>