18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4477 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4477  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  359  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.320227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1002  hypothetical protein  93.92 
 
 		 181 aa  315  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4327  hypothetical protein  94.48 
 
 		 185 aa  314  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4780  hypothetical protein  86.19 
 
 		 180 aa  288  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.472606  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0291  hypothetical protein  42.6 
 
 		 174 aa  124  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0267  hypothetical protein  42.6 
 
 		 174 aa  124  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.708651  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3117  hypothetical protein  41.14 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0466  hypothetical protein  44.29 
 
 		 174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.978743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2118  hypothetical protein  44.29 
 
 		 174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal  0.854449 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2387  putative lipid carrier protein-like protein  44.29 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0557516 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6297  hypothetical protein  40.91 
 
 		 168 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3474  hypothetical protein  39.73 
 
 		 223 aa  100  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.498948  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3004  putative lipid carrier protein-like protein  45.69 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4227  hypothetical protein  40.74 
 
 		 177 aa  88.2  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2400  putative lipid carrier protein-like protein  36.5 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4295  putative lipid carrier protein-like  46.22 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3493  putative lipid carrier protein-like protein  26.74 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  24.55 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>