25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2400 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2400  putative lipid carrier protein-like protein  100 
 
 
190 aa  379  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3004  putative lipid carrier protein-like protein  41.73 
 
 
179 aa  97.8  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195226  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2387  putative lipid carrier protein-like protein  36.44 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0557516 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0466  hypothetical protein  36.44 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.978743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2118  hypothetical protein  36.44 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal  0.854449 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4327  hypothetical protein  35.48 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457545  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4477  hypothetical protein  35.71 
 
 
181 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.320227  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1002  hypothetical protein  34.92 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4780  hypothetical protein  34.92 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.472606  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0267  hypothetical protein  34.71 
 
 
174 aa  72  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.708651  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0291  hypothetical protein  34.71 
 
 
174 aa  72  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3117  hypothetical protein  31.86 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4227  hypothetical protein  35.54 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4295  putative lipid carrier protein-like  36.23 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6297  hypothetical protein  28.97 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3474  hypothetical protein  33.98 
 
 
223 aa  55.8  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.498948  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1040  hypothetical protein  31.5 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2526  hypothetical protein  33.93 
 
 
227 aa  52  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2786  sterol-binding domain-containing protein  31.91 
 
 
170 aa  46.2  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1015  hypothetical protein  33.68 
 
 
165 aa  45.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0999  hypothetical protein  31.46 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3349  hypothetical protein  28.89 
 
 
170 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3195  sterol-binding domain-containing protein  31.96 
 
 
177 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0134  hypothetical protein  32.84 
 
 
160 aa  42  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2183  hypothetical protein  31.25 
 
 
150 aa  41.6  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.688747  unclonable  0.000000231276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>