34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4186 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2866  hypothetical protein  73.99 
 
 		 506 aa  784    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.582536  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3431  hypothetical protein  92.5 
 
 		 507 aa  944    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.794054  normal  0.867268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4186  hypothetical protein  100 
 
 		 507 aa  1031    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940999  normal  0.721152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2401  hypothetical protein  74.95 
 
 		 507 aa  811    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2179  hypothetical protein  75.74 
 
 		 507 aa  821    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1391  hypothetical protein  92.31 
 
 		 507 aa  941    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1249  hypothetical protein  90.87 
 
 		 505 aa  946    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.595191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0941  hypothetical protein  74.7 
 
 		 506 aa  808    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0582  hypothetical protein  71.37 
 
 		 504 aa  761    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2360  hypothetical protein  88.17 
 
 		 515 aa  887    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000403378  unclonable  0.000000201998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1177  hypothetical protein  88.1 
 
 		 505 aa  914    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0690  hypothetical protein  77.05 
 
 		 505 aa  804    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1426  hypothetical protein  60.2 
 
 		 512 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0428  hypothetical protein  83.04 
 
 		 507 aa  861    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637265  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1618  hypothetical protein  82.99 
 
 		 505 aa  866    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36380  hypothetical protein  57.85 
 
 		 521 aa  622  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4523  hypothetical protein  57.17 
 
 		 503 aa  618  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60020  hypothetical protein  56.58 
 
 		 503 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000198056  hitchhiker  0.0000000133883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3334  hypothetical protein  45.63 
 
 		 512 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3029  hypothetical protein  48.57 
 
 		 514 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2956  hypothetical protein  46.73 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0352  hypothetical protein  42.86 
 
 		 505 aa  431  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4071  hypothetical protein  43.5 
 
 		 512 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4161  hypothetical protein  43.3 
 
 		 507 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3699  hypothetical protein  38.19 
 
 		 507 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.925885  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0682  hypothetical protein  38.36 
 
 		 521 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1767  hypothetical protein  35.36 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03999  hypothetical protein  72.36 
 
 		 209 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0653  hypothetical protein  29.75 
 
 		 521 aa  212  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2750  hypothetical protein  29.06 
 
 		 541 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3921  hypothetical protein  23.97 
 
 		 544 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2395  hypothetical protein  19.31 
 
 		 522 aa  84.7  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1057  hypothetical protein  19.83 
 
 		 517 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1019  hypothetical protein  19.83 
 
 		 517 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>