34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2750 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2750  hypothetical protein  100 
 
 
541 aa  1109    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.256644  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0653  hypothetical protein  35.91 
 
 
521 aa  307  3e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36380  hypothetical protein  28.91 
 
 
521 aa  200  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3334  hypothetical protein  28.95 
 
 
512 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2401  hypothetical protein  29.34 
 
 
507 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2179  hypothetical protein  29.34 
 
 
507 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384212  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3699  hypothetical protein  27.08 
 
 
507 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.925885  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0690  hypothetical protein  29.55 
 
 
505 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256306  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2956  hypothetical protein  28.65 
 
 
512 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0941  hypothetical protein  28.08 
 
 
506 aa  187  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1426  hypothetical protein  28.99 
 
 
512 aa  187  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191891  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0682  hypothetical protein  27.11 
 
 
521 aa  186  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0582  hypothetical protein  29.91 
 
 
504 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1249  hypothetical protein  29.6 
 
 
505 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.595191  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2866  hypothetical protein  28.71 
 
 
506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.582536  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1177  hypothetical protein  30.1 
 
 
505 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315655  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60020  hypothetical protein  28.07 
 
 
503 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000198056  hitchhiker  0.0000000133883 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2360  hypothetical protein  29.73 
 
 
515 aa  182  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000403378  unclonable  0.000000201998 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4161  hypothetical protein  27.81 
 
 
507 aa  182  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4071  hypothetical protein  27.96 
 
 
512 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1618  hypothetical protein  29.28 
 
 
505 aa  180  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0352  hypothetical protein  27.57 
 
 
505 aa  180  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3431  hypothetical protein  29.68 
 
 
507 aa  180  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.794054  normal  0.867268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4523  hypothetical protein  27.52 
 
 
503 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0428  hypothetical protein  28.38 
 
 
507 aa  177  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637265  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3029  hypothetical protein  28.17 
 
 
514 aa  176  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4186  hypothetical protein  29.06 
 
 
507 aa  175  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940999  normal  0.721152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1391  hypothetical protein  29.28 
 
 
507 aa  174  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1767  hypothetical protein  26.76 
 
 
500 aa  167  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1057  hypothetical protein  22.52 
 
 
517 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1019  hypothetical protein  22.52 
 
 
517 aa  85.1  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2395  hypothetical protein  23.57 
 
 
522 aa  85.1  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3921  hypothetical protein  19.67 
 
 
544 aa  73.6  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03999  hypothetical protein  25.64 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>