34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0682 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0682  hypothetical protein  100 
 
 
521 aa  1071    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3699  hypothetical protein  73.53 
 
 
507 aa  809    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.925885  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4161  hypothetical protein  45.12 
 
 
507 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4071  hypothetical protein  44.83 
 
 
512 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0352  hypothetical protein  44.34 
 
 
505 aa  447  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0690  hypothetical protein  41.51 
 
 
505 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256306  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2401  hypothetical protein  39.57 
 
 
507 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2179  hypothetical protein  38.79 
 
 
507 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384212  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3334  hypothetical protein  38.05 
 
 
512 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2360  hypothetical protein  40.08 
 
 
515 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000403378  unclonable  0.000000201998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0582  hypothetical protein  38.31 
 
 
504 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1249  hypothetical protein  39.53 
 
 
505 aa  398  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.595191  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2866  hypothetical protein  38.32 
 
 
506 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.582536  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0941  hypothetical protein  39.05 
 
 
506 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2956  hypothetical protein  39.37 
 
 
512 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1618  hypothetical protein  39.23 
 
 
505 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3431  hypothetical protein  39.51 
 
 
507 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.794054  normal  0.867268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4186  hypothetical protein  38.36 
 
 
507 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940999  normal  0.721152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36380  hypothetical protein  40.23 
 
 
521 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1391  hypothetical protein  39.63 
 
 
507 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1177  hypothetical protein  38.81 
 
 
505 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315655  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1767  hypothetical protein  38.58 
 
 
500 aa  381  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1426  hypothetical protein  38.05 
 
 
512 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191891  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0428  hypothetical protein  38.43 
 
 
507 aa  381  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637265  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4523  hypothetical protein  38.21 
 
 
503 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60020  hypothetical protein  38.21 
 
 
503 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000198056  hitchhiker  0.0000000133883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3029  hypothetical protein  39.02 
 
 
514 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03999  hypothetical protein  40.8 
 
 
209 aa  196  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0653  hypothetical protein  26.67 
 
 
521 aa  193  7e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2750  hypothetical protein  27.11 
 
 
541 aa  186  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.256644  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3921  hypothetical protein  22.62 
 
 
544 aa  118  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2395  hypothetical protein  23.49 
 
 
522 aa  86.7  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1019  hypothetical protein  19.15 
 
 
517 aa  66.6  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1057  hypothetical protein  19.15 
 
 
517 aa  66.6  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>