34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1177 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2866  hypothetical protein  73.99 
 
 
506 aa  784    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.582536  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3431  hypothetical protein  89.03 
 
 
507 aa  896    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.794054  normal  0.867268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4186  hypothetical protein  88.1 
 
 
507 aa  914    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.940999  normal  0.721152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2401  hypothetical protein  75.1 
 
 
507 aa  801    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2179  hypothetical protein  76.1 
 
 
507 aa  810    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384212  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1391  hypothetical protein  93.78 
 
 
507 aa  939    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1249  hypothetical protein  94.85 
 
 
505 aa  983    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.595191  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0941  hypothetical protein  75.1 
 
 
506 aa  801    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0582  hypothetical protein  72.08 
 
 
504 aa  768    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2360  hypothetical protein  87.97 
 
 
515 aa  883    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000403378  unclonable  0.000000201998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1177  hypothetical protein  100 
 
 
505 aa  1026    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315655  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0690  hypothetical protein  77.25 
 
 
505 aa  804    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256306  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1426  hypothetical protein  60.47 
 
 
512 aa  643    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191891  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0428  hypothetical protein  80.71 
 
 
507 aa  830    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637265  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1618  hypothetical protein  79.17 
 
 
505 aa  847    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36380  hypothetical protein  57.48 
 
 
521 aa  624  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4523  hypothetical protein  56.78 
 
 
503 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.390807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60020  hypothetical protein  56.19 
 
 
503 aa  609  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000198056  hitchhiker  0.0000000133883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3334  hypothetical protein  46.63 
 
 
512 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3029  hypothetical protein  50 
 
 
514 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2956  hypothetical protein  47.28 
 
 
512 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0352  hypothetical protein  44 
 
 
505 aa  428  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4071  hypothetical protein  43.44 
 
 
512 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4161  hypothetical protein  43.63 
 
 
507 aa  420  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3699  hypothetical protein  39.8 
 
 
507 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.925885  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0682  hypothetical protein  38.81 
 
 
521 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1767  hypothetical protein  36.09 
 
 
500 aa  370  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03999  hypothetical protein  72.36 
 
 
209 aa  311  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0653  hypothetical protein  29.62 
 
 
521 aa  210  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2750  hypothetical protein  30.1 
 
 
541 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.256644  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3921  hypothetical protein  23.72 
 
 
544 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2395  hypothetical protein  18.66 
 
 
522 aa  77  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1057  hypothetical protein  19.59 
 
 
517 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1019  hypothetical protein  19.59 
 
 
517 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>